Bc. Natália Langová

Master's thesis

In silico studium pohlavně vázaných genů pomocí bioinformatických přístupů

In silico study of sex linked genes by bioinformatic approaches
Abstract:
Cílem této práce je analýza sekvenčních dat u šťovíku (Rumex acetosa) a chmele (Humulus lupulus) a identifikace jejich pohlavně vázaných genů. Pro tento účel byly použity programy LinkYX a Sex-DETector, které úspěšně identifikovaly potenciální pohlavně vázané geny. Výsledky byly následně anotovány pomocí programu BLAST a byly identifikovány jejich homology. Následně bylo vybráno několik kandidátních …more
Abstract:
The aim of this thesis is the analysis of sequencing data in a sorrel (Rumex acetosa) and a hop (Humulus lupulus) and identifying their sex-linked genes. Programs LinkYX and Sex-DETector were used for this purpose successfully identifying potential sex-linked genes. Results were subsequently annotated using BLAST and their homologs were identified. Subsequently several candidates were selected to be …more
 

Keywords

Šťovík kyselý Rumex acetosa Chmel otáčivý Humulus lupulus pohlavně vázané geny pohlaví pohlavní chromozomy NGS LinkYX Sex-DETector X chromozom Y chromozom BLAST Gelová elektroforéza
 
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 12. 8. 2020
Identifier: https://is.muni.cz/th/mvt31/

Thesis defence

  • Date of defence: 7. 9. 2020
  • Supervisor: Ing. Radim Čegan, Ph.D.

Citation record

Cite this text

Full text of thesis

Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:
  • světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta
Složka Reference to the local database directory of the institution

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / field:
Biochemistry / Chemoinformatics and Bioinformatics

Theses on a related topic

List of theses with an identical keyword.