Proteolytic control of transcriptional repressor in Arabidopsis thaliana

Meriam KVASHYLAVA

Bakalářská práce

Abstract:

In this research, I focus on the issue of proteolytic control of transcriptional repressors in Arabidopsis thaliana. The work was concentrated on the E3 plant ligases, which are the largest group among ubiquitin-proteasome proteolysis enzymes in plants. They make up the CUL3/RING complex. It is divided into numerous sections: RBX1, CUL3, BPM. A special focus was placed on the Cullin and BPM domains. Transcriptional regulators from the ETHYLENE RESPONSIBLE FACTORS family are degraded by this complex and its component units. These transcription factors are degraded through the ubiquitination, or more precisely, polyubiquitinalsiation process. This procedure includes the step of tagging the protein with ubiquitin, followed by proteasome cleavage. So, in this research paper I tried to determine how the plant phenotype is affected by the knockout of the genes encoding E3 ligases and which plant tissues these modifications are seen in.

Abstract:

V tomto výzkumu se zaměřuji na problematiku proteolytické kontroly transkripčních represorů u Arabidopsis thaliana. Práce byla soustředěna na rostlinné ligázy E3, které jsou největší skupinou mezi ubiquitin-proteazomovými proteolytickými enzymy v rostlinách. Tyto enzymy tvoří komplex CUL3/RING. Ten zahrnuje tří základní složky: RBX1, CUL3, BPM. Zvláštní důraz byl kladen na domény Cullin a BPM. Transkripční regulátory z rodiny ETHYLENE RESPONSIBLE FACTORS jsou degradovány tímto komplexem a jeho složkami. Tyto transkripční faktory jsou degradovány ubikvitinačním nebo přesněji polyubikvitinačním procesem. Tento proces zahrnuje krok značkování proteinu ubiquitinem, následovaný štěpením proteazomu. V této výzkumné práci jsem se pokusila zjistit, jak je rostlinný fenotyp ovlivněn knockoutem genů kódujících ligázy E3 a ve kterých rostlinných pletivech lze tyto modifikace sledovat.

Keywords

Arabidopsis thaliana, E3 ligázy, cul3, BPM, ubiquitin-proteazomální proteolýza

Jazyk práce: angličtina

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 28. 7. 2022

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Yoshihisa Ikeda, Ph.D.

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biologie / Molekulární a buněčná biologie