Podrobná genetická charakterizace kmenů rotaviru A získaných od lidských pacientů

Bc. Anna Blahová

Master's thesis

Detailed genetic characterization of rotavirus A strains collected from human patients

Anotácia:

Rotaviry A jsou velmi infekční virové částice způsobující akutní dětské průjmy až úmrtí dítěte. Podrobnější klasifikace této skupiny je v současné době založena na molekulárních vlastnostech genomových segmentů kódujících proteiny VP7 a VP4 nacházející se ve vnější vrstvě virové částice, a také protein střední vrstvy VP6. Díky zjištění genotypu lze nejen pozorovat šíření jednotlivých typů, ale také například účinnost vakcinace. Celkem bylo zpracováno 167 vzorků pocházejících od lidských pacientů trpících průjmy, které byly vyhodnoceny jako RVA pozitivní a tyto vzorky byly podrobeny genotypizaci. Nejčastěji byl identifikován genotyp G1P[8], zatímco nejméně běžné kombinace genotypů byly G2P[4] a G3P[9].

Abstract:

Rotaviruses A are highly infectious virus particles that cause acute childhood diarrhea and may result in child fatality. A more detailed classification of this group is currently based on the molecular properties of the genomic segments coding VP7 and VP4 proteins, which can be found within the outer layers of the viral particles, and the VP6 protein that is located inside the middle layer. By analysing the genotype, it is possible to observe the spread of individual strains, but also the possible effectiveness of vaccination. The total of 167 samples collected from human patients suffering from diarrhea was processed. They have been evaluated as RVA positive and further subjected to genotyping. The most frequently detected was G1P[8] genotype, while the least common combinations of genotypes were G2P[4] and G3P[9].

Kľúčové slová

Rotavirus, gastroenteritida, klasifikace genotypizace, Česká republika, gastroenteritis, classification, genotyping, Czech Republic

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 30. 7. 2020

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 10. 9. 2020
• Vedúci: Mgr. Romana Moutelíková, Ph.D.
• Oponent: Mgr. Bc. Darina Čejková, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Experimental Biology / Special Biology