Identifikace vazebných partnerů CDK13 pomocí BioID technologie

Bc. Šimon Sládek

Diplomová práce

Identification of CDK13-associating partners by use of BioID technology

Anotace:

Diplomová práce se zabývá identifikací vazebných partnerů cyklin-dependentní kinázy 13 (CDK13), která hraje klíčovou roli v regulaci transkripce a buněčných procesů důležitých pro embryonální vývoj. Pomocí metody proximální biotinylace BioID byl v myších embryonálních fibroblastech analyzován proximální interaktom CDK13. Získaná proteomická data byla vyhodnocena bioinformatickými nástroji s cílem identifikovat proteiny a buněčné dráhy asociované s funkcí CDK13.

Abstract:

This diploma thesis focuses on the identification of binding partners of cyclin-dependent kinase 13 (CDK13), a key regulator of transcription and cellular processes essential for embryonic development. Using the BioID proximity labeling approach, the proximal interactome of CDK13 was analyzed in mouse embryonic fibroblasts. The obtained proteomic data were further evaluated using bioinformatic tools to identify proteins and cellular pathways associated with CDK13 function.

Klíčová slova

CDK13, cyklin-dependentní kináza, protein-proteinové interakce, proximální interaktom, BioID, transkripční elongace, cyclin-dependent kinase, protein-protein interactions, proximal interactome, transcriptional elongation

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 7. 1. 2026

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 4. 2. 2026
• Vedoucí: doc. Mgr. Jiří Kohoutek, Ph.D.
• Oponent: Mgr. Tomáš Gybeľ, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Bioanalytická laboratorní diagnostika ve zdravotnictví - Lékařská genetika a molekulární diagnostika / Bioanalytická laboratorní diagnostika ve zdravotnictví - Lékařská genetika a molekulární diagnostika