Metody pro hodnocení životaschopnosti Xanthomonas euvesicatoria po ošetření nízkoteplotním plazmatem

Bc. Marta ZEMANOVÁ

Master's thesis

Methods for viability evaluation of Xanthomonas vesicatoria after low temperature plasma treatment

Anotácia:

Práce se zabývá metodami pro hodnocení životaschopnosti fytopatogenní bakterie Xanthomonas euvesicatoria po ošetření nízkoteplotním plazmatem. Ke generování plazmatu byl použit experimentální přístroj gliding arc. Viabilita bakteriálních buněk byla sledována pomocí skenovacího elektronového mikroskopu (SEM) a měřením fluorescence prostřednictvím chemické reagencie PrestoBlue v zařízení Smart-DART. Byla optimalizována metodika pro přípravu vzorků k ošetření nízkoteplotním plazmatem a následné vyhodnocení použitými metodami. Prostřednictvím SEM byly prokázány letální účinky gliding arc plazmatu na tuto gramnegativní bakterii. Na povrchu buňky dochází k výrazným strukturálním změnám. Hodnocení životaschopnosti X. euvesicatoria pomocí přístroje Smart-DART představuje rychlé, časově nenáročné a levné zhodnocení viability buněk. Velkou výhodou tohoto zařízení je měření fluorescence v reálném čase. Nevýhodou této metody je prozatím její nižší spolehlivost.

Abstract:

The thesis deals with methods for viability evaluation of the phytopathogenic bacterium Xanthomonas euvesicatoria after low-temperature plasma treatment. Low-temperature plasma produced by Gliding Arc experimental device was used for treatment of X. euvesicatoria. The viability of the bacterial cells was assessed using a scanning electron microscope (SEM) and by measuring of the fluorescence in the Smart-DART device using PrestoBlue chemical reagent. Methodology has been optimised for the sample preparation for the treatment by low temperature plasma and used for evaluation of applied methods. Lethal effect of gliding arc plasma to this gram-negative bacteria was verified by SEM which showed. There is significant structural changes on the cell surface. Viability assessment of X. euvesicatoria using Smart-DART device is a fast, time-saving and inexpensive evaluation of cell viability. The great advantage of this device is its ability to measure the fluorescence in real time. The disadvantage of this method is lower reliability in current stage of research.

Kľúčové slová

Xanthomonas euvesicatoria, nízkoteplotní plazma, gliding arc, PrestoBlue, resazurin, SEM, Smart-DART

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 21. 4. 2017

Obhajoba závěrečné práce

• Vedúci: Ing. Pavel Beran, Ph.D.

UNIVERSITY OF SOUTH BOHEMIA IN ČESKÉ BUDĚJOVICE

Faculty of Agriculture

Master programme / odbor:
Agriculture Engineering / Agricultural Biotechnology