Molekulární profilování exozomálních mikroRNA v séru periferní krve pacientů s Waldenströmovou makroglobulinémií

Bc. Klára Baďurová

Master's thesis

Molecular profiling of exosomal microRNA in serum of peripheral blood in Waldenström macroglobulinemia patients

Abstract:

Waldenströmova makroglobulinémie a mnohočetný myelom jsou maligní onemocnění patřící mezi monoklonální gamapatie. Ty jsou charakteristické výskytem monoklonálního imunoglobulinu v séru a/nebo v moči pacientů. U Waldenströmovy makroglobulinémie se jedná o monoklonální imunoglobulin typu IgM. U mnohočetného myelomu je nejčastější monoklonální imunoglobulin typu IgG, ale vyskytují se i další izotypy včetně IgM. Pro diagnostiku těchto onemocnění se používá také biopsie kostní dřeně, proto je žádoucí nalezení biomarkerů, které by bylo možno získat méně invazivní cestou. mikroRNA jsou krátké nekódující molekuly RNA, které jsou velmi stabilní, a proto mohou sloužit jako vhodné biomarkery. Exozomy jsou typem extracelulárních vezikulů, které slouží k buněčné komunikaci a obsahují i mikroRNA. Táto práce je zaměřena na detekci rozdílů obsahu mikroRNA v exozomech séra periferní krve pacientů s Waldenströmovou makroglobulinémií, mnohočetným myelomem a zdravých dárců pomocí sekvenování nové generace. Na základě dat ze sekvenování nové generace byly vybrány 3 mikroRNA – miR-4732-5p, 92a-3p a miR-191-5p, které měly největší rozdíl mezi skupinami pacientů s Waldenströmovou makroglobulinémií a mnohočetným myelomem, jejichž exprese byla validována pomocí RT-qPCR a hladiny exprese těchto mikroRNA následně porovnávány s klinickými daty pacientů.

Abstract:

Waldenström macroglobulinemia and multiple myeloma are malignant monoclonal gammopathies. They are characterized by the presence of monoclonal immunoglobulin in the serum and/or urine of patients. In Waldenström macroglobulinemia patients, monoclonal immunoglobulin IgM is detected. In multiple myeloma, the most common monoclonal immunoglobulin is IgG, but other isotypes, including IgM, also occur. A bone marrow biopsy is used to diagnose these diseases, so it is desirable to find biomarkers that could be obtained in a less invasive way. microRNAs are short non-coding RNA molecules that are very stable and therefore can be used as suitable biomarkers. Exosomes are a type of extracellular vesicles that have a role in cellular communication and also contain microRNAs. This work is focused on the detection of differences in microRNA content in exosomes obtained from peripheral blood serum of patients with Waldenström macroglobulinemia, multiple myeloma and healthy donors using next generation sequencing. Based on next generation sequencing data, 3 microRNAs – miR-4732-5p, 92a-3p and miR-191-5p – were selected, which had the greatest difference between WM and MM patients. Their expression was validated using RT-qPCR, and the expression levels of these microRNAs were subsequently compared with clinical data of patients.

Keywords

Waldenströmova makroglobulinémie, mnohočetný myelom, mikroRNA, exozom, sérum periferní krve, Waldenström macroglobulinemia, multiple myeloma, microRNA, exosome, peripheral blood serum

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 14. 5. 2023

Thesis defence

• Date of defence: 26. 6. 2023
• Supervisor: doc. RNDr. Sabina Ševčíková, Ph.D.
• Reader: Mgr. Táňa Macháčková, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / field:
Bioanalytical Laboratory Diagnostics in Medicine - Medical Genetics and Molecular Diagnostics / Bioanalytical Laboratory Diagnostics in Medicine - Medical Genetics and Molecular Diagnostics