Stanovení přesné pozice genu M73 ovlivňujícího dobu kvetení u Arabidopsis thaliana metodou pozičního klonování

Bc. Helena Pospíšková

Diplomová práce

Precise mapping of M73 flowering time gene in Arabidopsis thaliana by map-based cloning aproach.

Anotace:

Cílem této práce bylo zpřesnit pozici genu M73 ovlivňujícího dobu do kvetení. Pro rekombinační analýzu pomocí DNA markerů byly použity recesivně homozygotní rostliny generace F2 po křížení standardní linie Col a mutantní M73. V oblasti předpokládané pozice genu M73 bylo vytvořeno šest zcela nových polymorfních DNA markerů typu CAPS. Rekombinační analýzou provedenou pomocí dvou z nich byla zjištěna silná vazba s genem M73. Tím se podařilo zpřesnit lokalizaci genu do úzké oblasti na krátkém raménku chromozomu č. 4 u A. thaliana, v níž se nachází 22 kandidátních genů.

Abstract:

The main objective of this thesis was to specify a map position of the flowering time gene M73 in A. thaliana. The progeny after cross wild type genotype Col and mutant M73, the recessive homozygote plants of F2 generation were used for recombination analysis. In region of assumed position of the gene M73, six new polymorfic DNA markers (type CAPS) were developed. Recombination analysis was performed with the use of two new DNA markers. It was found close linkage with gene M73, so that precise localization of the gene was obtained. The gene was located at the narrow sector of the short arm chromosome 4 in A. thaliana. In this sector there are 22 candidate genes.

Klíčová slova

mapování, gen M73, DNA markery, gen ovlivňující dobu do kvetení, A. thaliana, metoda pozičního klonování

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 23. 5. 2007

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 12. 6. 2007
• Vedoucí: RNDr. Pavel Lízal, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biologie / Molekulární biologie a genetika