Modelování výskytu čejky chocholaté Vanellus vanellus v ČR

Bc. Markéta Chaloupková

Master's thesis

Distribution modeling of the Northern Lapwing Vanellus vanellus in the Czech Republic

Abstract:

Tato práce se zabývá modelováním druhové distribuce čejky chocholaté (Vanellus vanellus). Pro modelování byla použita nalézová data z databáze ČSO z období 2009 až 2014 z celého území České republiky ve formě vektorových GIS souborů a environmentální podmínky prostředí (prediktory) ve formě geodat. Jednalo se o nadmořskou výšku, krajinný pokryv, svažitost, vzdálenost od osídlení, vzdálenost od vodních ploch a toků, vzdálenost od lesů. Klimatické prediktory (průměrná roční teplota a průměrné roční srážky) byly z finálního modelu vyřazeny kvůli vysoké korelaci s nadmořskou výškou. Pro zodpovězení otázky, kde by se mohly nalézat další území s požadovanými podmínkami pro výskyt čejek, jsem vytvořila 5 modelů pro celé území ČR, do 4 modelů byla zahrnuta data, která se odlišovala charakterem podmínek prostředí nebo početností v lokalitě. Pro 2 modely s názvy AGROENVI_T (tradiční) a AGROENVI byla vybrána data splňující podmínky pro zařazení lokalit do agroenvi programu, 2 modely s názvy VHODNÉ_A, VHODNÉ_B zahrnující všechny vhodné podmínky pro výskyt čejek a pátý byl ze všech vstupních dat.Pro modelování potenciální distribuce jsem vybrala algoritmus MaxEnt a vytvořila predikční model. Pro další analýzy jsem převedla rastr z kontinuální predikce (od 0 až 100 % pravděpodobnosti) na binární predikci pomocí threshold a zjistila tak území s potenciálně vysokou pravděpodobností výskytu čejky, tzv. hot spots. Dále jsem zjistila celkovou rozlohu území v rámci ČR, které má dle modelů vhodné podmínky pro výskyt čejek ale doposud zde nebyla zjišťována přítomnost či nepřítomnost čejek. Výsledky analýz jsou prezentovány ve formě mapových výstupů (predikčních map) pro celou Českou republiku.

Abstract:

This thesis deals with modeling of potencial distribution of the Nothern Lapwing (Vanellus vanellus) in the Czech Republic. I used species' occurrence data from database of the CSO (Czech Society for Ornithology), from the period 2009 - 2014 of the entire territory of the Czech Republic in the form of vector GIS files. Environmental conditions were extracted from the Corine Land Cover 2012 and U.S. Geological Survey in the form of geodata. They include altitude, land cover, slope, distance from the settlement, distance from water bodies and distance from the woods. Climatic predictors (the average annual temperature and mean annual precipitation) were discarded from the final model due to high correlation with altitude. To answer the question, where could be found another area with suitable conditions for occurrence of Northern Lapwings, I created five models for the entire area of the Czech Republic. Four models included data with variety of the character of environmental conditions or abundance in the area. Data fulfilling the conditions for inclusion of sites in the Agrienvironmental measure for lapwings on arable land were selected into two models. Presence data connected with all favorable conditions for the occurrence of Northern Lapwings were included in two another models.The fifth model included all presence data. I chose Maxent algorithm for modeling the potential distribution and created predictive models. For further analysis I transferred raster of continuous prediction (from 0 to 100% probability) to the binary prediction using a threshold to determine areas with potentially high probability of presence lapwings, so called hotspots. Then I found an area within the territory of the Czech Republic with suitable conditions for the occurrence of Northern Lapwings but so far there hasn´t been a research for presence or absence of Northern Lapwings. The outcome of the analysis is presented in the form of map outputs of potential occurrence of the northern lapwings for the entire area of the Czech Republic.

Keywords

modelování distribuce druhů, čejka chocholatá, Vanellus vanellus, SDM, nika, ArcGIS, MaxEnt

Keywords

species distribution modeling, Northern Lapwing, MaxEnt, ecological niche, GIS, SDM

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 13. 4. 2017

Thesis defence

• Supervisor: prof. Dr. Mgr. Miroslav Šálek

Czech University of Life Sciences Prague

Faculty of Environmental Sciences

Master programme / field:
Engineering Ecology / Nature Conservation