Diagnostika amyloidózy z podkožního tuku, Studium metylačních změn u mnohočetného myelomu

MUDr. Pavla FLODROVÁ

Disertační práce

Diagnosis of amyloidosis from subcutaneous fat aspiration - Analysis of DNA methylation profile in multiple myeloma

Anotace:

Práce se zabývá dvěma tématy. V první části je diskutovaná problematika diagnostiky systémové AL amyloidózy ze vzorku podkožního tuku, srovnání dvou diagnostických metod - mikroskopického vyšetření nátěrů tukové tkáně barvených Kongo červení a proteomické analýzy pomocí LC/MS. Dále je implementována metoda vyšetření podkožní tukové tkáně za pomoci cytobloku. Práce kromě analýzy výsledků navrhuje algoritmus s optimálním zapojením jednotlivých vyšetřovacích metod. V druhé části se práce zabývá metylačními změnami u pacientů s mnohočetným myelomem, se zaměřením na globální metylaci genomu stanovenou nově zavedenou metodou Luminometrické metylační analýzy (LUMA) a pyrosekvenační analýzou vybraných sekvencí genů PDLIM4 a CDKN2B.

Abstract:

The thesis is dealing with two scientific topics. Systemic AL amyloidosis is discussed in the first part. In the study, the comparison of two diagnostic approaches - microscopic examination of Congo red stained smears of the fat tissue (the material was obtained by subcutaneous fat aspiration) and proteomic analysis - LC/MS was performed. A cytoblock as a diagnostic approach for subcutaneous fat aspiration was implemented. An optimal diagnostic algorithm from subcutaneous fat sample is designed to involve individual examination methods. The study of DNA methylation changes in multiple myeloma patients is included in the second part of the thesis. The study is focused on global genome methylation and methylation of selected gene sequences in PDLIM4 and CDKN2B. For global DNA methylation the Luminometric Methylation Analysis (LUMA) was implemented, methylation analysis of particular gene sequences was performed by pyrosequencing.

Klíčová slova

amyloidóza, aspirace tukové tkáně, Kongo červeň, hmotnostní spektrometrie, metylace DNA, globální metylace genomu, pyrosekvenování, mnohočetný myelom

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 1. 2. 2021

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Ing. Kateřina Smešný Trtková, CSc.

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Lékařská fakulta

Doktorský studijní program / obor:
Lékařská biologie / Lékařská biologie