Výpočet interakční energie amfifilních peptidů – Bc. Daniel Jaroň
Bc. Daniel Jaroň
Master's thesis
Výpočet interakční energie amfifilních peptidů
Calculations of free energy of interaction of amphiphilic peptides
Abstract:
Coiled-coil (CC) je strukturní motiv, který je často přítomný v proteinech a to jak v uspořádání samotného proteinu tak jejich samouspořádaných struktur. Nejjednodušším typem CC je dimer složený ze dvou podélně orientovaných α-helixů držících u sebe pomocí hydrofobní interakce. Typickým charakterem takových helixů jsou specificky opakující se sekvence po sedmi aminokyselinách značených A-G. Cílem této …moreAbstract:
Coiled-coil (CC) is a structural motif very abundant among proteins and is one of the main structural components of self-assembly structures. The simplest type of CC is a dimer formed from two parallel α helices, which are bound together via hydrophobic interaction. Typical characteristics of such helices are specific pattern of seven amino acids noted A-G. The goal of the thesis was to investigate …more
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 7. 1. 2019
Identifier:
https://is.muni.cz/th/pqtr8/
Thesis defence
- Date of defence: 6. 2. 2019
- Supervisor: doc. RNDr. Robert Vácha, PhD.
- Reader: RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D.
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasaryk University
Faculty of ScienceMaster programme / field:
Biochemistry / Chemoinformatics and Bioinformatics
Theses on a related topic
-
Theoretical methods in calculation of hydration free energy of hydrophobic molecules
Jakub Smutek -
Molekulová dynamika a výpočty volných energii mono a di-nukleotidových analogů s potenciálním antibiotickým účinkem
Hana Zigová -
Výpočty volných energií konformačních změn vybraných fragmentů nukleových kyselin
Barbora Benešová -
Použití metod pro výpočet volných energií k studiu biomolekulárních procesů
Ivo Kabelka -
Nové metody výpočtů volných energií pro studium interakcí protein-ligand
Daniela Toulcová -
Výpočet väzobného profilu volnej energie formovania proteínových dimérov.
Ján Tungli -
Stanovení volné povrchové energie vybraných pevných látek metodou sedící kapky
Hynek Ondráček -
Studium konformačního chování amyloidu beta a jeho mutantů v pozici 35 metodami molekulového modelování
Libuše Dvořáková