Výpočet interakční energie amfifilních peptidů – Bc. Daniel Jaroň
Bc. Daniel Jaroň
Diplomová práce
Výpočet interakční energie amfifilních peptidů
Calculations of free energy of interaction of amphiphilic peptides
Anotace:
Coiled-coil (CC) je strukturní motiv, který je často přítomný v proteinech a to jak v uspořádání samotného proteinu tak jejich samouspořádaných struktur. Nejjednodušším typem CC je dimer složený ze dvou podélně orientovaných α-helixů držících u sebe pomocí hydrofobní interakce. Typickým charakterem takových helixů jsou specificky opakující se sekvence po sedmi aminokyselinách značených A-G. Cílem této …víceAbstract:
Coiled-coil (CC) is a structural motif very abundant among proteins and is one of the main structural components of self-assembly structures. The simplest type of CC is a dimer formed from two parallel α helices, which are bound together via hydrophobic interaction. Typical characteristics of such helices are specific pattern of seven amino acids noted A-G. The goal of the thesis was to investigate …více
Jazyk práce: angličtina
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 7. 1. 2019
Identifikátor:
https://is.muni.cz/th/pqtr8/
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 6. 2. 2019
- Vedoucí: doc. RNDr. Robert Vácha, PhD.
- Oponent: RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D.
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasarykova univerzita
Přírodovědecká fakultaMagisterský studijní program / obor:
Biochemie / Chemoinformatika a bioinformatika
Práce na příbuzné téma
-
Theoretical methods in calculation of hydration free energy of hydrophobic molecules
Jakub Smutek -
Molekulová dynamika a výpočty volných energii mono a di-nukleotidových analogů s potenciálním antibiotickým účinkem
Hana Zigová -
Výpočty volných energií konformačních změn vybraných fragmentů nukleových kyselin
Barbora Benešová -
Použití metod pro výpočet volných energií k studiu biomolekulárních procesů
Ivo Kabelka -
Nové metody výpočtů volných energií pro studium interakcí protein-ligand
Daniela Toulcová -
Výpočet väzobného profilu volnej energie formovania proteínových dimérov.
Ján Tungli -
Stanovení volné povrchové energie vybraných pevných látek metodou sedící kapky
Hynek Ondráček -
Studium konformačního chování amyloidu beta a jeho mutantů v pozici 35 metodami molekulového modelování
Libuše Dvořáková