Degradace mRNA indukovaná předčasně zařazeným terminačním kodonem

Mgr. Johana Plch

Bakalářská práce

Nonsense-mediated mRNA decay

Anotace:

Bakalářská práce se zabývá kontrolním mechanismem NMD (nonsense-mediated mRNA decay) eukaryotických buněk. Mechanismus má za úkol rozpoznat předčasně zařazený terminační kodon (nesmyslný kodon), zabránit translaci a vzniku proteinů se zkráceným C-koncem, které mohou být pro buňku potenciálně škodlivé. NMD je regulován buněčným stresem jako např. hypoxií nebo aminokyselinovou deprivací. Inhibice NMD se podílí na onkogenní transformaci. Při inhibici NMD roste hladina mRNA, respektive substráty pro NMD se stabilizují a zvyšuje se exprese proteinu, který kódují. Mechanismu NMD podléhají i nádorově supresorové geny, jako např. TP 53, jejichž funkce úzce souvisí s regulací buněčného cyklu a genové exprese.

Abstract:

The thesis deals with surveillance mechanism in eukaryotic cells called nonsense-mediated mRNA decay (NMD). NMD is a mechanism which recognizes transcripts carrying premature termination codon (PTC, nonsense codon). The purpose of NMD is to prevent translation and synthesis of C-terminally truncated proteins that could have negative impact on cell. The pathway is regulated by wide variety of cellular stresses such as hypoxia or amino-acid deprivation. NMD inhibition affects tumorigenesis. The inhibition of NMD has implications for the upregulation and stabilization of NMD substrates and the expression of proteins. NMD also regulates tumour suppressor genes such as TP 53, which function is closely related to cell cycle regulation and gene expression.

Klíčová slova

CZ, Degradace mRNA, NMD, předčasně zařazený terminační kodon (PTC), UPF1/Upf1, UPF2/Upf2, UPF3/Upf3, SMG1, EJC, DSE, SURF, TP53/p53. EN, mRNA degradation, nonsense-mediated decay (NMD), premature codon (PTC), TP53/p53.

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 7. 5. 2012

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 18. 6. 2012
• Vedoucí: prof. RNDr. Jana Šmardová, CSc.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biologie / Molekulární biologie a genetika