Detekce interakce onkogenních forem p53 s nekanonickými strukturami DNA

Mgr. Magda Vodičková

Bakalářská práce

Detection of oncogenic p53 interaction with non-B DNA structures

Anotace:

Mutace v genu TP53 jsou spojeny se ztrátou vlastností typických pro standardní protein a u mnohých typů mutantů dokonce se vznikem onkogenního potenciálu. Pro funkci proteinu p53 jsou důležité jeho sekvenčně specifické a strukturně selektivní interakce s DNA. Interakce sekvenčně specifická hraje významnou úlohu při aktivaci transkripce jiných regulačních bílkovin. Schopnost proteinu p53 selektivně interagovat s některými strukturami DNA slouží k rozpoznávání poškozené DNA, s čímž zřejmě souvisí i podíl p53 na regulaci procesů reparace a rekombinace. Současné výsledky naznačují, že jak při sekvenčně specifických, tak při nespecifických interakcích p53 s DNA hraje důležitou roli konformace a topologie cílové oblasti DNA. Tato práce shrnuje dosavadní poznatky o interakcích mutp53 s alternativními strukturami DNA ve srovnání s interakcemi wtp53-DNA a poukazuje na možný vliv výskytu takových struktur v regulačních oblastech cílových genů mutp53 na jejich transaktivaci či represi.

Abstract:

Mutations in TP53 are associated with loss of typical characteristics for the standard protein and many mutant form even with the emergence of oncogenic potential. For p53 function sequence-specific and structure-selective interaction with DNA are important. Sequence-specific interaction plays a crucial role in activating transcription of other regulatory proteins. The ability of p53 to selectively interact with certain DNA structures is pivotal for recognizing damaged DNA which appears to be connected with participation of p53 in regulating repair processes and recombination. Present results suggest that in both sequence-specific and nonspecific p53-DNA interactions the conformation and topology of the target DNA plays an important role. This thesis summarizes the current knowledge of interactions mutp53 with alternative DNA structures in comparison with wtp53-DNA interactions and also points to the potential impact of presence such structures in the regulatory regions of mutp53 target genes on their transactivation or repression.

Klíčová slova

TP53, wtp53, mutp53, nekanonická struktura DNA, non-B-DNA structure, superhelikální DNA, superhelical DNA, transaktivace, transactivation, represe, repression

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 14. 5. 2010

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 21. 6. 2010
• Vedoucí: Mgr. Marie Brázdová, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biologie / Molekulární biologie a genetika