Systematika a ekologie krevet rodu Periclimenaeus (Crustacea: Decapoda: Palaemonidae) asociovaných s mořskými houbami

Tereza GRYGAROVÁ

Bachelor's thesis

Systematics and ecology of spongobiotic shrimps of the genus Periclimenaeus (Crustacea: Decapoda: Palaemonidae)

Anotácia:

Bakalářská práce je zaměřena na vypracování literární rešerše o fylogenezi, rozšíření a biologii krevet rodu Periclimenaeus konkrétně na druhy žijící v mořských houbách. Rod Periclimenaeus v současnosti zahrnuje přibližně 80 druhů s největší diverzitou v Indo-západotichomořské oblasti. Součástí bakalářské práce je rozbor morfologických adaptací týkající se symbiotického vztahu. Praktická část je zaměřena na osvojení si základních postupů v molekulární laboratoři (izolace DNA, PCR, elektroforéza), zpracování získaných sekvencí a tvorbu fylogenetických stromů metodou Maximální věrohodnosti. Amplifikovány byly geny Histon 3 a 16S rRNA. Předběžné výsledky fylogenetické analýzy indikují na možnou parafylii rodu Periclimenaeus.

Abstract:

This Bachelor thesis is focused on providing a literature review about phylogeny, distribution and biology of shrimps of the genus Periclimenaeus with concentrate on species living with marine sponges. In the present the genus Periclimenaeus includes aproximatelly 80 species with the most diversity in the Indo-West Pacific region. A part of the Bachelor thesis is an analysis of morphological adaptations concerning symbiotic relation. The practical part is dedicated on basic processes in the molecular laboratory (isolation of DNA, PCR, electrophoresis), processing of obtained sequences and creation of phylogenetic trees by Maximum likelihood method. Genes Histone 3 and 16S rRNA was amplified. Preliminary results of phylogenetic analysis indicates on potential paraphyly of the genus Periclimenaeus.

Kľúčové slová

Decapoda, krevety, Palaemonidae, Periclimenaeus, morfologické adaptace, fylogeneze, symbióza, houbovci

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 24. 4. 2017

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 22. 5. 2017
• Vedúci: Mgr. Ivona Horká

University of Ostrava

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Biology / Systematic Biology and Ecology