microRNA a jejich význam v sepsi

Terezie MACKOVÁ

Bakalářská práce

MicroRNA and their role in sepsis

Anotace:

microRNA jsou krátké jednovláknové molekuly RNA, které hrají zásadní roli v regulaci genové exprese, díky čemuž se podílí na důležitých procesech, jako je ontogenetický vývoj, růst, umlčování genů, imunita a vznik nádorů. Jsou stabilnější než molekuly mRNA a lze je získat z tělních tekutin, v nichž cirkulují. To je činí zajímavými molekulami pro další studium, neboť jejich vlastnosti slibují využití těchto molekul jako neinvazivní biomarkery různých nádorových onemocnění a patologických stavů. Mezi takové patologické stavy patří i sepse - systémová zánětlivá odpověď na infekční podnět. Její nebezpečí spočívá především v tom, že je pro správnou léčbu nutná včasná a přesná diagnostika, která dnes stále ještě není úplně vyvinuta. Bylo zjištěno, že hodnoty exprese určitých molekul microRNA při sepsi jsou odlišné od hodnot u zdravých lidí a že se tyto hodnoty mohou lišit i mezi různě závažnými stádii sepse. Pro studium hodnot exprese vybraných molekul microRNA při sepsi byl v této práci z důvodu blízké fyziologické a morfologické příbuznosti s člověkem použit prasečí gnotobiotický model. Na základě dostupné odborné literatury byly vybrány dvě microRNA, jejichž hodnota exprese by se při sepsi měla měnit (hsa-mir-182-5p, hsa-mir-150-5p) a jedna microRNA, která by ve vybraných vzorcích měla sloužit jako referenční gen (hsa-mir-192). Hodnoty exprese vybraných microRNA byly stanoveny u tří skupin selat konvenčních, bezmikrobních a septických, u všech skupin byly tyto hodnoty sledovány v jaterní tkáni a plazmě. Byla zvolena vhodná metoda izolace a detekce microRNA z jaterní tkáně a plazmy selat. Statistickými programy bylo provedeno zhodnocení rozdílů v hodnotách exprese sledovaných microRNA mezi jednotlivými skupinami.

Abstract:

microRNAs are small single-stranded RNA molecules that play key role in regulation of gene expressions. They take part in important processes such as ontogenesis, growth, gene silencing, immunity and tumorigenesis. They are more stable than mRNA molecules and they can be obtained from body fluids. That makes them important molecules for further study because their characteristics promise use of these molecules as non-invasive biomarkers for different kinds of cancer and pathological stages. Such pathological stages include sepsis systemic inflammatory response syndrome caused by infection. The danger of sepsis consists in the fact that for the correct therapy of sepsis is need for timely and proper diagnostics. However, the diagnostic methods have not been fully developed yet. It was found that expression profiles of some microRNA molecules vary between septic patients and healthy people. The expression profiles also vary among different stages of sepsis. A pig gnotobiotic model was used for a study of expression profiles of selected microRNA due to closed physiological and morphological similarity of the pig to the human. Based on the available literature two microRNAs which expression profiles should be changed in sepsis (hsa-mir-182-5p, hsa-mir-150-5p) and one microRNA which should be used as reference gene (hsa-mir-192) were chosen. Expression profiles of selected microRNAs were measured in three groups of piglets convetional, germ-free and septic piglets. In these groups expression profiles were measured in liver tissue and plasma. The differences in expression profiles between the groups were carried out by statistical evaluation.

Klíčová slova

microRNA, sepse, RT-qPCR, gnotobiotický, sele

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 7. 5. 2014

Zveřejnit od: 7. 5. 2014

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Ing. Bc. Igor Šplíchal, CSc.

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biologie / Molekulární a buněčná biologie