Systém pro odhad entropie a detekci struktury v biologickych sekvencich. – Bc. Vojtěch Bystrý, Ph.D.
Bc. Vojtěch Bystrý, Ph.D.
Diplomová práce
Systém pro odhad entropie a detekci struktury v biologickych sekvencich.
Entropy estimation and structure detection in biological sequences.
Anotace:
Práce popisuje obecné principy určení míry entropie, detailněji se pak věnuje možnostem odhadu entropie v biologických sekvencích. V textu je prezentován nová aplikace pro kompresi proteinových sekvencí ProteinPress. Aplikace pracuje na principu kombinace statistických expertů, který vylepšuje o možnost hierarchického navazování a adaptuje jej na proteinové sekvence. Praktickou část práce představuje …víceAbstract:
This thesis describes principles of entropy rate estimation in general and focuses on methods of entropy estimation for biology sequences. New application for protein compression ProteinPress is presented. Basic principle of application is combination of statistical experts, which is improved by possibility of expert hierarchical linking and adapts it to protein sequences. Project implements ProteinPress …více
Jazyk práce: čeština
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 23. 5. 2008
Identifikátor:
https://is.muni.cz/th/ytfjz/
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 1. 7. 2008
- Vedoucí: Ing. Matej Lexa, Ph.D.
- Oponent: doc. Mgr. Pavel Rychlý, Ph.D.
Citační záznam
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasarykova univerzita
Fakulta informatikyMagisterský studijní program / obor:
Aplikovaná informatika / Bioinformatika
Práce na příbuzné téma
-
Interakce proteinu p53 s DNA: studium vlivu látek modulujících strukturu DNA, koncentrace solí a využití elektrochemických metod ke studiu protein-DNA interakcí
Peter Šebest -
Analýza DNA vazebných proteinů se zaměřením na jejich interakce s lokálními strukturami DNA
Natália Valková -
Ligandy rozpoznávající alternativní struktury DNA: studium vazby ligand-DNA v roztoku a na elektricky nabitých površích a vliv na viabilitu buněk
Petra Mikušová -
Vlastnosti nekanonických bázových párů v DNA a DNA/protein komplexech
Anežka Tichá -
Lokální struktury DNA, jejich analýza a využití v DNA origami
Jakub Vilímek -
Elektrochemické metody pro detekci interakcí DNA s proteiny a pro sledování enzymatických přeměn DNA
Monika Hermanová -
Co nám říká neandertálská DNA o Homo sapiens neanderthalensis? Mitochondriální DNA versus jaderná DNA.
Šárka Řezáčová -
Studium afinity DNA vazebných proteinů ke kvadruplexové DNA
Jana Surmová