Detekce bakterií rodu Xanthomonas patogenních pro rajče a papriku metodou multiplex PCR

Mariia RAGOZINA

Bachelor's thesis

Detection of disease caused strain Xanthomonas phytopathogenic for tomato and pepper by multiplex PCR

Anotácia:

Předmětem této bakalářské práce je optimalizace multiplex PCR pro detekci patogenních bakterií rodu Xanthomonas. Spoužitím primerových párů Bs-Xg (Koenraadt et al., 2007), Bs-Xp (Koenraadt et al., 2007), Xe_330CG1,2 (Stehlíková a Beran, nepublikováno) a Xv_367CG1-1,9 (Stehlíková a Beran, nepublikováno) byla úspěšně optimalizována multiplex PCR reakce pro detekci Xanthomonas gardneri, Xanthomonas perforans, Xanthomonas euvesicatoria a Xanthomonas vesicatoria v jedné reakci. Vybrané primerové páry byly testované na rozsáhlém souboru jiných bakterií patogenních pro rajče a papriku.

Abstract:

The subject of this work is the optimization of multiplex PCR for the detection of pathogenic bacteria of the genus Xanthomonas. Were successfully managed to optimized multiplex PCR reaction for simultaneous detection of Xanthomonas gardneri, Xanthomonas perforans, Xanthomonas euvesicatoria, and Xanthomonas vesicatoria using four primer pairs: Bs-Xg (Koenraadt et al., 2007), Bs-Xp (Koenraadt et al., 2007), Xe_330CG1,2 (Stehlíková a Beran, unpublished) and Xv_367CG1-1,9 (Stehlíková a Beran, unpublished). The selected primer pairs were also tested on a wide scale of other bacteria of Xanthomonas genus and non-Xanthomonas pathogens for tomatoes and peppers.

Kľúčové slová

Xanthomonas vesicatoria, euvesicatoria, gardneri, perforans, multiplex PCR

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 23. 4. 2021

Obhajoba závěrečné práce

• Vedúci: Ing. Dagmar Stehlíková

UNIVERSITY OF SOUTH BOHEMIA IN ČESKÉ BUDĚJOVICE

Faculty of Agriculture

Bachelor programme / odbor:
Agriculture / Agricultural Biotechnology