Software for the fast detection of A-phased repeats from genome assemblies – Bc. Jaroslav Kubín
Bc. Jaroslav Kubín
Bachelor's thesis
Software for the fast detection of A-phased repeats from genome assemblies
Software for the fast detection of A-phased repeats from genome assemblies
Abstract:
Pro řešení současných výzev moderní biologie, jako je rozpoznávání motivů specifických biologických sekvencí, je zásadní vývoj nových výpočetních nástrojů. Jedna třída takových sekvencí se nazývá A-phased repeats, tradičně definováno jako alespoň tři běhy A-traktů s 10-bp fázováním. Je pozoruhodné, že v lidském genomu je přítomno minimálně 1 milion těchto motivů. Tyto motivy mohou změnit kanonický …moreAbstract:
To address current challenges of the modern biology, such as motif recognition of specific biological sequences, the development of novel computational tools is crucial. One class of such sequences is called A-phased repeats, traditionally defined as at least three runs of A-tracts with 10-bp phasing. Notably, at least 1 million A-phased repeats are present in the human genome. A-phased repeats can …more
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 19. 5. 2022
Identifier:
https://is.muni.cz/th/ff6ty/
Thesis defence
- Date of defence: 1. 7. 2022
- Supervisor: Mgr. Monika Čechová, Ph.D.
- Reader: Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Citation record
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasaryk University
Faculty of InformaticsBachelor programme / field:
Informatics / Informatics
Theses on a related topic
- No theses on a related topic available.