Krystalizace a strukturní studium farmakologicky potenciálně zajímavých malých molekul a supramolekul metodami difrakce RTG záření na monokrystalech

Bc. Viktorie Navarová

Master's thesis

Crystallization and structural study of pharmacologically potentially interesting small molecules or supramolecules by single crystal X-ray diffraction

Anotácia:

Tato práce se zabývá možným využitím metody krystalizace pod vrstvou oleje za použití nového screenu Small Molecule Anion Screen MD1-125 od firmy Molecular Dimensions pro vytvoření krystalů farmakologicky potenciálně zajímavých malých molekul. První experimenty byly provedeny pro čisté cyklodextriny, následně byla metoda vyzkoušena na komplexech cyklodextrinů. Vzniklé monokrystaly byly zkoumány metodou RTG difrakce, naměřená difrakční data byla analyzována pomocí softwaru SHELXL a byl vytvořen 3D strukturní model molekuly.

Abstract:

The possibilities of microbatch under-oil technique for crystallization of pharmacologically potentially interesting small molecules using the crystallization robots and the Small Molecule Anion Screen MD1-125 from Molecular Dimensions was studied. For the first experiments a pure cyclodextrins were used, later crystallization of several cyclodextrins complexes were conducted. The X-ray diffraction experiment was performed with the obtained single-crystal, diffraction data were analysed by software SHELXL. Finally the 3D structure model of the molecule was created.

Keywords

RTG difrakce, monokrystal, malá molekula, krystalizace pod vrstvou oleje, Small Molecule Anion Screen MD1-125, X-ray diffraction, Single crystal, Small molecule, Under-oil crystallization

Jazyk práce: English

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 16. 5. 2022

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 16. 6. 2022
• Vedúci: doc. RNDr. Jaromír Marek, Ph.D.
• Oponent: Mgr. Tomáš Klumpler, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Physics / Biophysics