Adsorpce antimicrobiálních peptidů na fosfolipidové membrány – Bc. Adam Dobiáš
Bc. Adam Dobiáš
Bachelor's thesis
Adsorpce antimicrobiálních peptidů na fosfolipidové membrány
Adsorption of antimicrobial peptides at phospholipid membranes
Abstract:
Antimikrobiální peptidy jsou součástí vrozeného imunitního sytému mnoha organizmů. Adsorpce těchto peptidů na biologické membrány je úzce spojena s jejich efektivitou a specificitou. V téhle práci jsme studovali efekt lipidového složení membrány, sekundární struktury peptidů a bodových mutací v sekvenci peptidu na adsorpci. Tyto efekty byly studovány za pomocí molekulové dynamiky s použitím techniky …moreAbstract:
Antimicrobial peptides are a part of innate immune system of many organisms. Adsorption of these peptides on biological membranes is closely related to their effectiveness and specificity. In this thesis, we study effect of membrane lipid composition, effect of peptide secondary structure, and point mutations in peptide sequence on adsorption. These effects were studied using molecular dynamics with …moreKeywords
antimikrobiální peptidy sekundární struktura mutace biologické membrány výpočetní chemie výpočty volných energií umbrella sampling hrubozrnné modely soft matter antimicrobial peptides secondary structure mutations biological membranes computational chemistry free energy calculations coarse-grained models
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 16. 5. 2018
Identifier:
https://is.muni.cz/th/p7djm/
Thesis defence
- Date of defence: 13. 6. 2018
- Supervisor: Mgr. Ivo Kabelka
- Reader: José Gaspar Rangel Pamplona Pizarro Pinto
Citation record
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasaryk University
Faculty of ScienceBachelor programme / field:
Biochemistry / Chemoinformatics and Bioinformatics
Theses on a related topic
-
Free Energy Calculations as a Tool of Supramolecular and Biomolecular Chemistry
Zora Střelcová -
Computational Study on Lectin-Carbohydrate Complexes
Navnit Kumar Mishra -
Computational Investigations of Biomolecular Systems and Comparison with Experiments in Various Environmental Conditions
Morteza KHABIRI -
Použití metod pro výpočet volných energií k studiu biomolekulárních procesů
Ivo Kabelka -
Effect of anisaxin, cecropin-like antimicrobial peptide on \kur{Borrelia burgdorferi} sensu stricto viability
Mediha KURBEGOVIĆ -
Výpočet profilů Gibbsovy energie chemické reakce pomocí ab initio molekulové dynamiky kombinované s metodou Umbrella sampling
Pavel CHMELAŘ