Netelomerické funkce ochranných proteinových komplexů telomer

Mgr. Milan Hluchý

Bachelor's thesis

Nontelomeric functions of shelterin proteins

Abstract:

This bachelor’s thesis concentrates on the study of interaction partners and non-telomeric functions of the human shelterin complex. The human shelterin complex consists of six proteins which shape and safeguard telomeres through DNA binding. Shelterin binds telomeres, the natural chromosome ends, and forms them into lasso-like structures called T-loops. Shelterin maintains continuous replication of telomeres and protects telomeric ends from DNA repair mechanisms via multiple interactions with nuclear proteins. The first section of the thesis focuses on DNA damage response pathways and their inhibition on telomeres by the shelterin complex. Next part is dedicated to selected proteins cooperating with the shelterin complex on replication of telomeres. One chapter focuses on TERRA, Telomeric Repeat Containing RNA. The final part of this thesis describes non-telomeric functions of shelterin proteins, specifically TRF2 and Rap1. This bachelor thesis sums up the current state of knowledge about non-telomeric functions of proteins, which primarily take part in the regulation of telomere length.

Abstract:

V tejto bakalárskej práci sa venujeme interakčným partnerom a netelomérickým funkciám ľudského shelterinového komplexu. Ľudský shelterinový komplex sa skladá zo šiestich proteínov, ktoré väzbou na telomérické opakovania pomáhajú modelovať a chrániť teloméry. Shelterin sa viaže na teloméry, prirodzené konce eukaryotických chromozómov, kde vyvoláva ohyb DNA do lasovitej štruktúry s názvom T-slučka. Početnými interakciami s proteínmi prítomnými v jadre zabezpečuje shelterinový komplex plynulú replikáciu telomér a chráni konce telomérickej DNA pred opravnými mechanizmami bunky. Táto bakalárska práca sa zameriava na popis signálnych a opravných dráh bunky, ktoré reagujú na poškodenie DNA a mechanizmy ich blokácie na telomérach pomocou shelterinového komplexu. Nasleduje popis vybraných proteínov, ktoré interagujú so zložkami shelterinového komplexu a pomáhajú hlavne pri replikácií telomér. Samostatná kapitola je zameraná na TERRA, RNA obsahujúcu telomérické repetície. Posledná časť bakalárskej práce sa venuje netelomérickým funkciám proteínov shelterinového komplexu, konkrétne proteínom TRF2 a Rap1. Táto bakalárska práca zhrňuje súčasné poznatky o netelomérických funkciách proteínov, ktoré sa primárne podieľajú na regulácií dĺžky telomér.

Kľúčové slová

telomera, DNA, protein, telomeráza, shelterin, TRF1, TRF2, Rap1, POT1, netelomerické funkce, homologická rekombinace, oprava DNA, dvouvláknové zlomy teloméra, netelomérické funkcie, homologická rekombinácia, dvojvláknové zlomy telomere, telomerase, nontelomeric functions, homologic recombination, DNA repair, double strand breaks

Jazyk práce: Slovak

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 9. 5. 2012

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 18. 6. 2012
• Vedúci: doc. Mgr. Ctirad Hofr, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Biology / Molecular Biology and Genetics