Bioinformatika

Mgr. Michal GRÉČ

Bachelor's thesis

Bioinformatics

Anotácia:

Tato práce čtenáře uvede do základních principů a pojmů bioinformatiky. Kapitoly 1-4 jsou věnovány bioinformatice jako takové, to znamená otázkám jak se pracuje s daty, jaké jsou formáty dat, kde najdeme informace o sekvencích na internetu a jak se posuzuje podobnost sekvencí. Kapitoly 5-7 nám nastiňují problematiku využití nejpoužívanějších algoritmů převzatých z bioinformatiky(FASTA a BLAST), které se používají i v jiných aplikacích, než bioinformatických. Praktická část je věnována rozbor DNA sekvence ve FASTA formátu a její následné analýze.

Abstract:

The main part of this bachelor thesis documents the philosophy and terms from bioinformatics. The first chapters (1-4) are dedicated to bioinformatics as a whole, i.e. to questions such as data processing, data formats, sequence information sources on the internet and how to qualify similarity of sequences. Chapters 5-7 provide an overview of using the most widely used bioinformatics algorithms (FASTA and BLAST) that are also used in other areas. The practical part includes a research of a DNA sequence in FASTA format with a follow-up analysis.

Kľúčové slová

bioinformatika, algoritmus, sekvence DNA, proteiny, databáze

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 7. 4. 2009

Zverejniť od: 7. 4. 2009

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 26. 5. 2009
• Vedúci: doc. RNDr. PaedDr. Eva Volná, Ph.D.

University of Ostrava

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Information Science / Information Science