Interakce proteinů p63 s DNA in vitro a in vivo

Bc. Matej Adámik

Diplomová práce

Interactions of p63 with DNA in vitro and in vivo

Abstract:

In this thesis the transcription factor p63 appointed as the oldest and most conserved anti-oncogene p53 family member was studied. Theoretical chapters focus on p63 sequence specific interactions with DNA and its consequences in cells. In experimental section, the sequence and structure specific DNA interactions of GST-tagged p63 central domain were studied and compared to DNA interactions of other p53 family members. The temperature and metal ion influence on p63 sequence specific DNA binding was investigated. Electrophoretic, immunoprecipitation and microscopic methods were used for in vitro studies. Luciferase reporter assay was applied to study p63 interactions with DNA in H1299 cells.

Abstract:

Tato práce se zabývá transkripčním faktorem p63, který bývá označován za pravděpodobně nejstaršího člena známé antionkogenní proteinové rodiny p53. Teoretická část shrnuje poznatky o tomto proteinu a soustřeďuje se na vznik a důsledky specifické interakce p63 s DNA in vitro a in vivo. V experimentální části byla zkoumána sekvenčně a strukturně specifická interakce centrální domény p63 označené GST s DNA a byla porovnávána s vazbou ostatních členů proteinové rodiny p53. Taktéž byl zkoumán vliv teploty a dvojmocných kationtů kovů na sekvenčně specifickou vazbu p63 k DNA. Elektroforetické, imunoprecipitační a mikroskopické techniky byly využity k studiu in vitro. K studiu interakce p63 s DNA v buňkách H1299 bylo využito luciferázového reportérového testu.

Klíčová slova

p63, p53 family, sequence specific DNA binding, rodina p53, sekvenčne špecifická väzba na DNA

Jazyk práce: slovenština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 15. 5. 2013

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 5. 6. 2013
• Vedoucí: Mgr. Marie Brázdová, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biochemie / Biochemie