Studium inhibitorů matrix metaloproteináz s využitím dockingu – Mgr. Jan Ryška
Mgr. Jan Ryška
Bachelor's thesis
Studium inhibitorů matrix metaloproteináz s využitím dockingu
Docking study of matrix metalloproteinase inhibitors
Abstract:
Molekulové dokování je důležitým nástrojem používaným v mnoha oblastech výpočetní chemie. Cílem protein-ligand dokování je nalezení energeticky výhodných vazebných módů ligandu s proteinem, jehož trojrozměrnou strukturu známe. Tato práce je zaměřena na popis několika běžných postupů a algoritmů používaných při hledání optimální konformace výsledného protein-ligand komplexu. Klade si též za cíl poskytnout …moreAbstract:
Molecular docking is an important tool in computational chemistry and computer-aided drug design. The goal of ligand-protein docking is to identify favored binding modes of a ligand with a protein of known three-dimensional structure. This thesis is focused on describing several approaches and algorithms used to find the optimal conformation of resulting ligand-protein complex. It also aims to provide …more
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 12. 5. 2011
Identifier:
https://is.muni.cz/th/ouigd/
Thesis defence
- Date of defence: 17. 6. 2011
- Supervisor: doc. RNDr. Radka Svobodová Vařeková, Ph.D.
- Reader: Mgr. Zdeněk Kříž, Ph.D.
Citation record
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasaryk University
Faculty of ScienceBachelor programme / field:
Biochemistry / Chemoinformatics and Bioinformatics