Chromera velia heme pathway localization

Mgr. Jitka RICHTOVÁ

Doctoral thesis

Abstract:

This thesis is focused on the localization of the heme pathway in Chromera velia - the closest known photosynthetic relative of apicomplexan parasites. The heme pathway belongs to essential processes in most living organisms. Organisms use enzymes of various evolutionary origins, reflecting their complex evolutionary history. The core of this study represents the combination of computational and experimental localization of the C. velia heme pathway. We showed that the localization of the heme pathway in the cell is driven by multiple factors, including the demand for pathway products, the need for tight regulation of the pathway, and the evolutionary origin of the enzymes

Abstract:

Práce se zaměřuje na lokalizaci hemové dráhy u řasy Chromera velia, která je nejbližším známým fotosyntetizujícím příbuzným parazitů ze skupiny Apicomplexa. Hemová dráha je jednou z esenciálních biochemických drah většiny žijících organismů. Organismy používají pro syntézu hemu enzymu lišící se svým evolučním původem, který odráží jejich složitou evoluční historii. Základem této práce je kombinace in výpočetních a experimentálních lokalizací enzymů hemové dráhy řasy Chromera velia. Ukázali jsme, že lokalizace hemové dráhy v rámci buňky je řízena vícero faktory zahrnující poptávku po produktech dráhy, potřebu přísné regulace a v neposlední řadě i evolučním původem enzymů.

Keywords

Heme pathway, Chromera velia, protein targeting, protein predictions

Jazyk práce: English

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 6. 9. 2021

Obhajoba závěrečné práce

• Vedúci: prof. Ing. Miroslav Oborník, Dr.

UNIVERSITY OF SOUTH BOHEMIA IN ČESKÉ BUDĚJOVICE

Faculty of Science

Doctoral programme / odbor:
Molecular and Cell Biology / Molecular and Cell Biology and Genetics