Využití DNA markerů při identifikaci a lokalizaci nových genů odolnosti k padlí travnímu Blumeria graminis f. sp. hordei u ječmene Hordeum vulgare

Bc. Šárka Krejčová

Diplomová práce

Identification of new resistance genes to powdery mildew in barley by means of DNA markers

Anotace:

Padlí travní podmíněné houbou Blumeria graminis f. sp. hordei je nejčastější chorobou ječmene. Náplní diplomové práce bude vyhledávání DNA markerů založených na polymerázové řetězové reakci a studium polymorfismu u rodičovských linií použitých pro křížení a introdukci nových genů odolnosti k padlí travnímu do genomu ječmene Hordeum vulgare. Dalším úkolem bude studium charakteru dědičnosti a lokalizace genů odolnosti k padlí u linie PI466158 pomocí polymorfních DNA markerů. K tomuto budou využívány markery založené na polymerázové řetěrové reakci, především kodominantní SSR markery. K izolaci DNA markerů ve vazbě s genem odolnosti bude využívána tzv. bulk-segregační analýza. Polymorfní markery umožní analýzu segregující populace F2 a lokalizaci nových genů rezistence do genetické mapy ječmene. Realizace tohoto cíle umožní při praktickém šlechtění výběr potomstev s kombinací několika těchto účinných genů odolnosti s využitím těsně vázaných DNA markerů.

Abstract:

Powdery mildew, caused by the fungus Blumeria graminis f. sp. hordei is the most widespread disease of barley. The aim of the diploma thesis is detection of DNA markers based on polymerase chain reaction and analysis of polymofphism in the parent lines used for cross and introduction of new genes of resistance to powdery mildew into the genome of barley Hordeum vulgare. The next task is the analysis of the type of inheritance and localization of genes conferring resistance to powdery mildew in the line PI466158 by polymorphic DNA markers. The Polymerase Chain Reaction-based markers, especially codominant SSR markers, will be used. For isolation of DNA markers linked with the gene of resistance the bulk segregant analysis will be used. The analysis of segregating F2 population and localization of new genes of resistance into the genetic map of barley will be provided by polymorphic markers. Realisation of this purpose will allow the selection of progeny containing combination of several effectual genes of resistance using tightly linked DNA markers.

Klíčová slova

ječmen, Blumeria graminis f. sp. hordei, Hordeum vulgare ssp. spontaneum mikrosatelity, padlí travní, geny odolnosti

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 4. 1. 2007

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 9. 2. 2007
• Vedoucí: doc. RNDr. Jana Řepková, CSc.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biologie / Molekulární biologie a genetika