Přehled využití genomiky v chovu koní

Ondřej Plachý

Bachelor's thesis

Summary of the use of genomics in horse breeding

Anotácia:

V posledních letech dochází ke značnému rozvoji metod mapování genomu. Tyto metody jsou díky technologickému rozvoji dostupnější a méně finančně náročné pro využití samotnými chovateli. Cílem této bakalářské práce je sestavit souhrn možností konkrétního využití těchto metod v chovatelské praxi. Metodou analýzy SNP je v současné době běžně ověřována paternita hříbat. Analýza mtDNA je nástrojem pro dohledávání chyb v rodokmenech a je podkladem pro fylogenetické úvahy o tomto druhu. Podrobně jsou prostudovány genetické mechanismy související se zbarvením koní a pleiotropním působení těchto genů v souvislosti s dědičnými chorobami, jako jsou Overo Lethal White Syndrome, Lavender Foal Syndrome, souvislost Leopard spotting complex s kongenitální noční slepotou, či zvýšená incidence výskytu melanomů u běloušů. Je k dispozici řada dalších testů na zjištění mutace způsobující dědičné choroby, například HYPP, GBED, SCID a další. Výsledky těchto testů slouží chovatelům jako nástroj pro vhodný výběr rodičovských párů. V souvislosti s reprodukcí byly detekovány geny ovlivňující fertilitu, které mohou být využívány k určení predispozic u plemenných hřebců. Gen MSTN kódující syntézu myostatinu má zásadní vliv na vývoj svalové struktury. Tyto poznatky mohou být využity pro ranou selekci v dostihovém tréninku a pro určení distančního optima. Celý komplex editace genomu a sekvenování nabízí řadu možností využití v chovatelské praxi pro zlepšení ekonomiky produkce i welfare koní, může však být i zneužit.

Abstract:

Development of gene mapping have been extensively increased in recent years. Thanks to technological development , these genomic tools are now more available and less expensive for breeders use. The goal of this bachelor thesis is to present summary of specific possibilities of using these methods in breeding practice. SNP analysis are currently use for foal parentage verification. mtDNA analysis is tool for the finding a fauls in pedigrees and for fylogenetic research of horses. Genetic mechanism and pleiotropic effect of the genes encoded coat colour related with inherited deseases, such as Overo Lethal White Syndrome, Lavender Foal Syndrome, Congenital Night Blindness (related with Leopard Spotting Complex) and higher incidence of grey horses melanomas, was detailed described. Other tests for responsible mutations, caused inherited diseases, such as for example HYPP, GBED, SCID etc. are also currently available. The results of these tests are useful tool for breeders for parentage pairs selection. It was found the genes related with fertility, these research can be use for good stallion predispositions designation. MSTN gene encoding myostatin synthese have a great influence on muscle development. These knowledges can be used for early selection in trainig and for distant optimum assessment. Whole complex of genome edit and sequencing provide many useful options for using in breeding practice. These knowledges can improve economical success of breeders and positive affect the horses welfare. On the other hand, these knowledges can be also misuse.

Kľúčové slová

kůň, genomika, genetická testace, dědičné choroby, polymorfismus

Keywords

Genomics, Equine, Genetic Tests, Inherited diseases, Polymorfism

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 25. 3. 2017

Obhajoba závěrečné práce

• Vedúci: Ing. Barbora Hofmanová, Ph.D.

Czech University of Life Sciences Prague

Faculty of Agrobiology, Food and Natural Resources

Bachelor programme / odbor:
Animal Science / Companion Animals