Expresný profil DNA metyltransferáz u buniek mnohopočetného myelómu

Katarína ONDRUŠKOVÁ

Bakalářská práce

Expression profile of DNA methyltransferases in mutliple myeloma cells

Anotace:

Bakalárska práca je zameraná na stanovenie expresného profilu vybraných génov DNA metyltrasnferáz vo vzorkách pacientov s diagnostikovaným mnohopočetným myelómom a vzorkách myelómových bunkových línií. V teoretickej časti sú spracované základné informácie o DNA metyltransferázach, regulácii ich aktivity a ich funkciách. Druhá časť teórie pozostáva z charakteristiky ochorenia mnohopočetný myelóm, jeho diagnostiky, štádií ochorenia a možnostiach liečby. V experimentálnej časti bolo vykonané stanovenie expresných profilov troch DNA metyltransferáz - DNMT1. DNMT3A a DNMT3B pomocou metódy kvantitatívnej real-time PCR. Na expresné analýzy sledovaných génov bolo použitých 12 vzoriek pacientov s diagnostikovaným mnohopočetným myelómom a 6 vzoriek myelómových bunkových línií. Získané expresné profily boli porovnané medzi vzorkami pacientov s diagnostikovaným relabujúcim mnohopočetným myelómom a pacientov s novo diagnostikovaným mnohopočetným myelómom. Hodnoty relatívnych expresií génu DNMT1 u pacientov s novo diagnostikovaným mnohopočetným myelómom boli nižšie ako expresie génu DNMT3A; zvýšené expresie génu DNMT3A tak môžu byť dôležitým diagnostickým markerom u novo diagnostikovaných pacientov s mnohopočetným myelómom. U myelómových bunkových línií boli relatívne hodnoty aj 2 - deltaCt hodnoty expresií génov DNMT3A a DNMT3B kolísavé, ale nižšie ako relatívne hodnoty expresií génu DNMT1.

Abstract:

Bachelor thesis is aimed on specifying express profile of selected genes of DNA methyltransferases in patient samples with multiple myeloma diagnosed and samples of myeloma cell lines. In theoretical part, basic information about DNA methyltransferases, regulation of their activities and their functions are elaborated. Second part of theory characterizes multiple myeloma diseases, its diagnosis, stages of disease and treatment methods. In the experimental part, gene expression profiles of three DNA methyltransferases were determined: DNMT1, DNMT2 and DNMT3, with quantitative real time PCR method. For the expression analyzes of observed genes 12 patients samples diagnosed with multiple myeloma and 6 meyloma cell lines were used. Gathered expressio profiles were compared two groups of patients: patient samples with diagnosed relapsed multiple myeloma and patient samples with newly-diagnosed multiple myeloma. Value of relative DNMT1 gene expressions of patients with newly-diagnosed multiple myeloma was lower than the DNMT3A gene expression. Thus, the increased DNMT3A gene expression could be an important marker for diagnosis of new patients with multiple myeloma. Furthemore, in tested myeloma cell lines, both relative value and 2 - deltaCt value of DNMT3A and DNMT3B genes expression were fluctuating, and lower compared to the relative value of DNMT1 gene expression.

Klíčová slova

DNA metyltransferázy, mnohopočetný myelóm, DNMT1, DNMT3A, DNMT3B, expresný profil génu

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 6. 5. 2021

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Ing. Kateřina Smešný Trtková, CSc.

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biologie / Molekulární a buněčná biologie