Genové interakční sítě a jejich využití v odkrývání heterogenity nádoru kolorekta.

Bc. Andrea Janotová

Master's thesis

Application of gene interaction networks in unveiling heterogeneity of colorectal cancer.

Anotácia:

Molekulární biologie se ve 21. století již nezaměřuje pouze na jednotlivé geny nebo proteiny. Symbolem začátku nového tisíciletí se staly interakce mezi nimi a jednou z možností k jejich pochopení jsou genové interakční sítě. Protože genové sítě reprezentují interakce, slouží tak k porozumění dějů probíhajících uvnitř buněk a začaly být využívány i při zkoumání různých nemocí. Vkládá se do nich naděje, že mohou být součástí při určení individuálního rizika a prognózy pacienta nebo sehrát důležitou roli ve farmaceutickém výzkumu. Cílem práce bylo odvodit genové sítě pro podtypy pacientů s nádorem kolorekta a využít je ke zjištění rozdílů mezi nimi. Pacienti byli do podskupin rozděleni již na základě dřívějších analýz.

Abstract:

Molecular biology of the 21st century does not focus only on individual genes or proteins. A symbol of the new millennium are interactions between them. Gene interaction networks are a tool for understanding these interactions. Because gene networks represent interactions they serve to understand processes within living cells and they started to be studied in the context of various diseases. It is expected that they can play an important role in determining individual risk and prognosis of the patient or can help in pharmaceutical research. The aim of this thesis was to infer gene networks for subtypes of colorectal cancer patients in order to identify differences between them. Patients were divided into subgroups based on previous analyses.

Kľúčové slová

karcinom kolorekta, bezškálová síť, genové interakční sítě, metody pro odvození genových sítí, colorectal cancer, scale-free network, gene interaction networks, methods for gene networks

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 21. 5. 2012

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 20. 6. 2012
• Vedúci: Mgr. Eva Budinská, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Biology / Mathematical Biology