Úloha G4 struktur při regulaci vlastností RAD51 proteinu

Bc. Michaela Pospíšilová

Diplomová práce

Role of G4 structures in regulating RAD51 properties

Anotace:

Lidský genom je z velké části tvořen sekvencemi, které jsou náchylné na vytváření široké škály alternativních sekundárních DNA struktur, mezi které se řadí především vlásenky, kvadruplexy, triplexy a i-motivy. Tvorba těchto struktur může výrazně ohrozit stabilitu lidského genomu. Součástí lidského genomu je velké množství G4 motivů, které mohou za určitých okolností vytvořit quadruplex. G4 struktury mohou následně ovlivnit nejrůznější biologické procesy, jako například transkripci a replikaci. RAD51 protein se kromě dříve popsané opravy dvouřetezcových zlomů podílí také na restart DNA replikace. Pro lepší pochopení důležitosti jejich interakce pro zachování genomové integrity se tato diplomová práce se zaměřuje na charakterizaci vazby proteinu RAD51 na různé alternativními DNA sekundárními strukturami s využitím nejrůznějších biochemických a biofyzikálních metod.

Abstract:

Many sequences in human genome are prone to fold into variety of non-canonical secondary DNA structures, such as hairpin, quadruplex, triplex and i-motifs. These non-B structures can compromise integrity of human genome. Numerous of G4 motifs are present in human genome and under specific conditions they can be fold into quadruplex. G4 structures may affect distinct biological processes, such as transcription and replication. RAD51 protein is essential not only to repair of double-strand break but also to DNA replication restart. This diploma thesis focuses on characterization of RAD51 interaction with various alternative DNA secondary structures using plethora of biochemical and biophysical methods in order to understand their importance for genome integrity.

Keywords

RAD51 protein, Kvadruplex, Homologní recombinace, Alternativní DNA sekundární struktury, Replikace DNA, Quadruplex, Homologous recombination, Alternative DNA secondary structures, DNA replication

Jazyk práce: angličtina

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 15. 5. 2019

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 4. 6. 2019
• Vedoucí: doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biochemie / Biochemie