Sekvenování nové generace při studiu regulace genů u rostlin

Bc. David Vlk

Bachelor's thesis

New generation sequencing for the study of plant gene regulation

Anotácia:

Cílem této bakalářské práce je shrnout poznatky o současných možnostech využití sekvenování nové generace u rostlin, se zaměřením na studium regulace genů. Práce se věnuje základním sekvenačním technikám a jejich principům při určování pořadí bází, v další části je popsán potenciál využití sekvenování nové generace u rostlin při následné aplikaci těchto poznatků ve výzkumu a šlechtění. V současné době se sekvenování nové generace stává významným nástrojem ve šlechtění prostřednictvím poznání regulace klíčových genů determinujících vlastnosti, jako je odolnost ke stresům. K tomuto účelu se využívají celogenomové studie nebo studie transkriptomů, exomů, biosyntetických drah anebo skupin genů určité funkce.

Abstract:

The aim of this thesis is to summarize contemporary knowledge on the possibilities of use of next-generation sequencing in plants, especially in the study of gene regulation. At first, the common sequencing techniques and their principles for finding of the sequence of DNA are described, then the thesis deals with a potential of use of next-generation sequencing in plants and subsequent application in research and breeding. Nowadays, the next-generation sequencing becomes an important tool for plant breeding through knowledge of the regulation of important features such as resistance to stress. For this purpose, whole-genome studies, studies of transcriptomes, exomes, biosynthetic pathways or groups of genes of specific function are used.

Kľúčové slová

sekvenování nové generace, regulace genů, šlechtění, RNA-sekvenování, mikro RNA, epigenetika, next-generation sequencing, gene regulation, breeding, RNA-sequencing, micro RNA, epigenetics

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 3. 5. 2016

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 8. 6. 2016
• Vedúci: doc. RNDr. Jana Řepková, CSc.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Experimental Biology / Molecular Biology and Genetics