Segmentace buněčných jader v obrazech z konfokálního mikroskopu

Bc. Ondřej Rabiška

Diplomová práce

Cell nuclei segmentation in confocal microscope images

Anotace:

Diplomová práce je zaměřena na segmentaci biologických dat z laboratoře CBIA. Pro tuto práci byla vybrána segmentační metoda Active Mask Segmentation of Fluorescence Microscope Images. Původní algoritmus byl autory naimplementován v Matlabu, v diplomové práci byl naprogramován v C++. Algoritmus v C++ významně urychlil výpočet.

Abstract:

Thesis is dealing with segmentation of biologic images from CBIA laboratory. Active Mask Active Mask Segmentation of Fluorescence Microscope Images method was chosen for this work. Algorithm was originally implemented in Matlab, however C++ was used for this implementation. C++ significantly increased the speed of this algorithm.

Klíčová slova

regionální distribuční funkce, hlasovací distribuční funkce, aktivní masky, FFT kruhová konvoluce, funkce sigmoidního typu, vícestupňový blok, víceúrovňový blok

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 28. 5. 2012

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 26. 6. 2012
• Vedoucí: doc. RNDr. Pavel Matula, Ph.D.
• Oponent: doc. RNDr. David Svoboda, Ph.D.

Masarykova univerzita

Fakulta informatiky

Magisterský studijní program / obor:
Informatika / Počítačová grafika