Molekulové modelování aktivity halogenalkandehalogenáz s cyklodienovými insekticidy

Bc. David Bednář, Ph.D.

Bakalářská práce

Molecular Modelling of Haloalkane Dehalogenase Activity with Cyclodiene Insecticides

Anotace:

Insekticidy na bázi cyklodienů, aldrin, dieldrin, endrin, heptachlor či chlordan, patří mezi významné perzistentní organické polutanty rozšířené celosvětově. Enzymy halogenalkandehalogenázy štěpí mnohé chlorované perzistentní polutanty s obdobnou substrukturou a proto je možné předpokládat jejich aktivitu i s insekticidy na bázi cyklodienů. V rámci této bakalářské práce byl studován potenciál jednotlivých enzymů z rodiny halogenalkandehalogenáz odštěpit atom chloru z molekul insekticidů. Molekulové dokování bylo použito k přípravě struktur enzym-substrátového komplexu a posouzení možnosti vzniku aktivovaného komplexu v aktivním místě halogenalkandehalogenáz.

Abstract:

Polychlorinated insecticides are significant organic pollutants. Cyclodienes, like aldrin, dieldrin, endrin, heptachlor and chlordane are widely used persistent contaminants with a carcinogenic effect or toxic effect on nerve system. Haloalkane dehalogenases are enzymes cleaving a carbon-halogen bond in many similar chlorinated pollutants; therefore they can be expected to degrade also these cyclodiene insecticides. This Thesis focuses on the study of formation of reactive complexes between enzymes and insecticides by means of molecular docking.

Keywords

insekticid, organický polutant, halogenalkandehaloganáza, molekulové dokování, insecticide, organic pollutant, haloalkane dehalogenase, molecular docking

Jazyk práce: angličtina

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 14. 5. 2010

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 14. 6. 2010
• Vedoucí: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biochemie / Biochemie