Diversity and distribution study of viruses in the entomopathogenic fungus Beauveria bassiana in the Czech Republic

Bc. Petr VANĚČEK

Master's thesis

Diversity and distribution study of viruses in the entomopathogenic fungus Beauveria bassiana

Abstract:

Mykoviry jsou viry, které infikují houbové buňky, kde se i replikují, ale na rozdíl od většiny známých virů rostlin a živočichů mají jen výjimečně škodlivý vliv na jejich hostitele. Nicméně, poslední objevy ukazují, že některé mykoviry mohou snížit virulenci jejich fytopatogenních hostitelů, což dělá mykoviry velmi atraktivními z důvodu jejich možného využití v biologické ochraně. Většina mykovirů má dsRNA genomy a jsou rozšířené ve všech hlavních taxonech hub. Beauveria bassiana je jednou z nejvíce studovaných entomopatogenních hub. Má kosmopolitní rozšíření a v zemědělství je využívána v rámci biologické ochrany rostlin proti bezobratlým škůdcům. V této práci byla analyzována sbírka 137 vzorků B. bassiana získaných z odlišných lokalit a přírodních stanovišť v České republice. Tyto izoláty byly testovány na přítomnost dsRNA fragmentů indikujících virovou infekci. Výsledky odhalily vysoký výskyt virové infekce mezi českými izoláty B. bassiana, bylo detekováno 22,6% vzorků obsahujících dsRNA fragmenty s virovými charakteristikami. Získané elektroforeotypy dsRNA ukazují, že virová rozmanitost u infikovaných izolátů byla vysoká, a že se mezi izoláty objevily smíšené virové infekce. Na základě charakteristik elektroforetických profilů může být předpokládáno, že izoláty B. bassiana nasbírané v České republice mohly být infikovány zástupci virových čeledí Totiviridae, Partitiviridae, Chrysoviridae a Hypoviridae.

Abstract:

Mycoviruses are viruses that infect and replicate in fungal cells, but unlike most known viruses of plants and animals, they exceptionally produce deleterious effects on their host. Nonetheless, the last discoveries showed that some mycoviruses can decrease the virulence of their phytopathogenic fungal hosts, making them very attractive for their possible use as biological control agents. Most mycoviruses have dsRNA genomes and are widespread in all major taxa of fungi. Beauveria bassiana is one of the most studied species of entomopathogenic fungi; it has a cosmopolitan distribution and is used as biocontroller against invertebrates in agriculture. In the present work, a collection of 137 isolates of B. bassiana obtained at different locations and from different habitats in the Czech Republic was analysed. These isolates were analysed for the presence of dsRNA elements indicative of viral infections. The results revealed a high prevalence of viral infections in Czech B. bassiana isolates, with 22.6% of the isolates containing dsRNA elements with viral characteristics. Obtained dsRNA electropherotypes showed that virus diversity in infected isolates was high and that mixed virus infections occurred among them. Based on the characteristics of the electrophoretic band patterns, it could be hypothesized that B. bassiana isolates collected in the Czech Republic could harbour members of the viral families Totiviridae, Partitiviridae, Chrysoviridae and Hypoviridae.

Keywords

Beauveria bassiana, entomopatogenní houby, mykoviry, dsRNA

Language used: English

Date on which the thesis was submitted / produced: 24. 4. 2015

Accessible from:: 24. 4. 2015

Thesis defence

• Supervisor: Noemi Herrero Asensio, Dr.

UNIVERSITY OF SOUTH BOHEMIA IN ČESKÉ BUDĚJOVICE

Faculty of Agriculture

Master programme / field:
Agriculture Engineering / Agricultural Biotechnology