Interakce apoptotických mitochondriálních proteinů AIF a endonukleázy G s jadernými proteiny při degradaci chromatinu

Mgr. Pavel Eleder

Bakalářská práce

Interactions of apoptotic mitochondrial proteins AIF and endonuclease G with nuclear proteins during chromatin degradation

Anotace:

Proteiny AIF a endonukleáza G (endoG) reprezentují na kaspázách nezávislou dráhu apoptózy. Práce se zabývá jejich popisem, dále popisem vnitřní struktury jádra, způsobu uspořádání DNA v něm a charakteristikou enzymu topoizomeráza II, uplatňujícího se také v jaderné apoptóze. Po opuštění mitochondrie jsou AIF a endoG translokovány do jádra. Zde způsobují kondenzaci chromatinu, jeho hrubou fragmentaci a oligonukleozomální štěpení DNA. Protein AIF není nukleázou a endoG je za fyziologických podmínek nukleázou velmi slabou. K efektivní degradaci chromatinu je tedy zapotřebí jejich spolupráce s dalšími proteiny. AIF a endoG v jádře interagují s dalšími nukleázami, cyklofiliny a proteiny Hsp70, které mohou stimulovat nebo naopak inhibovat jejich proapoptotickou aktivitu. Představeny jsou také homology AIF a endoG v C. elegans a jejich interakce při procesech jaderné apoptózy.

Abstract:

AIF and endoG represent proteins of caspase-independent pathway of apoptosis. The thesis describes these proteins, internal nuclear structure, organization of DNA in nucleus and characterizes topoisomerase II enzyme, which is also involved in nuclear apoptosis. After released from mitochondria, AIF and endoG are translocated to the nucleus where they promote chromatin condensation, large-scale chromatin fragmentation and oligonucleosomal cleavage of DNA. AIF is not a nuclease and endoG has very low nuclease activity at physiological conditions. Therefore a cooperation with another proteins is required for effective chromatin degradation. AIF and endoG interact with other nucleases, cyclophilins and Hsp70 in nucleus, which can stimulate or inhibit their proapoptotic activity. AIF a endoG homologs of C. elegans are also introduced as well as their interactions in nuclear apoptosis.

Klíčová slova

apoptóza, na kaspázách nezávislá, apoptózu indukující faktor, endonukleáza G, degradace chromatinu, proteinové interakce, apoptosis, caspase-independent, apoptosis-inducing factor, endonuclease G, chromatin degradation, protein interactions.

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 14. 1. 2009

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 10. 2. 2009
• Vedoucí: Mgr. Miroslav Vařecha, Ph.D.
• Oponent: Mgr. Petra Procházková Schrumpfová, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biologie / Molekulární biologie a genetika