Transkriptomická analýza genóv aktívnych behom vývoja osemenia hrachu

Laura ŽABKOVÁ

Bakalářská práce

Transcriptomic analysis of pea seed coat development

Anotace:

Po oplodnení sa počas vývoja semena v procese embryogenézy formuje plán embrya a jednotlivé extraembryonálne štruktúry, endosperm a osemenie. Osemenie je pre semeno nesmierne dôležité, pretože nie len, že slúži ako zásobné pletivo a sprostredkováva komunikáciu medzi osemením a vonkajším prostredím, ale taktiež slúži pre semeno ako ochrana. Jedným z mechanizmov zabezpečujúcich ochranu semena je biochemická ochrana, ktorá je sprostredkovaná enzýmami, napríklad polyfenoloxidázou. V tejto bakalárskej práci sme sa zamerali na určenie relatívnej expresie polyfenoloxidázy. Expresia bola analyzovaná na štyroch genotypoch, a to na kultúrnych nedormantných genotypoch Cameor, ATC7025 a PI181958 a planom dormantnom genotype JI261. Expresná analýza ukázala, že polyfenoloxidáza je exprimovaná v najväčšej miere u planého pigmentovaného genotypu JI261 a v menšej miere aj u kultúrneho pigmentovaného genotypu ATC7025. U kultúrneho nepigmetovaného genotypu PI181958 bola len veľmi malá expresia polyfenoloxidázy a u kultúrneho genotypu Cameor nebola detekovaná takmer žiadna expresia. Túto skutočnosť sme potvrdili aj pomocou detekcie aktivity polyfenoloxidázy na rezoch osemením a hilom, pričom sme potvrdili aktivitu polyfenoloxidázy len na reze genotypom JI261 a genotype ATC7025, u genotypov PI181958 a Cameoru nebola aktivita polyfenoloxidázy detekovaná.

Abstract:

After fertilization, the plan of the embryo and individual extraembryonic structures, endosperm and testa, is formed. Testa is extremely important structure for the seed. It has not only the function as a storage tissue, exchanging information between the embryo and the external environment, but it also serves as protection for the seed One of the mechanisms ensuring seed protection is biochemical protection, which is mediated by enzymes, for example by polyphenol oxidase. In this bachelor's thesis, we focused on determining the relative expression of gene encoding polyphenol oxidase. The polyphenol oxidase expression was analyzed in seed coats of four genotypes, namely the non-dormant genotypes Cameor, ATC7025, PI181958 and the dormant genotype JI261. The gene expression analysis showed that polyphenol oxidase was expressed to the greatest extent in the wild pigmented genotype JI261 and to a lesser extent in the cultivated pigmented genotype ATC7025. Polyphenol oxidase expression was very low in the non-pigmented genotype PI181958 and almost no expression was detected in the Cameor genotype. The activity of the polyphenol oxidase enzyme was also detected on the testa sections.We detected the polyphenol oxidase activity only on sections of JI261 and ATC7025, polyphenol oxidase activity was not detected for genotypes PI181958 and Cameor.

Klíčová slova

polyfenoloxidáza, osemenie, hilum, obrana, hrach, semeno

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 5. 8. 2022

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Mgr. Jana Balarynová, Ph.D.

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biologie / Experimentální biologie