Nejčastější bakteriální původci střevních onemocnění u dospělých lidí v České republice

Kristýna KOPECKÁ, DiS.

Bachelor's thesis

The most common bacterial originators of intestinal diseases in adults in the Czech republic

Abstract:

Bakalářská práce, kterou jsem zpracovala, je zaměřena na téma nejčastější bakteriální původci střevních onemocnění u dospělých lidí v České republice. Ve své práci jsem se zaměřila na bakteriální střevní patogeny rodu Salmonella, Shigella, Yersinia, Campylobacter. V teoretické části práce se zabývám charakteristikou vybraných střevních bakteriálních patogenů a jejich mikrobiologickou diagnostikou. V dnešní době jde vývoj dopředu, objevují se různé moderní metody a přístroje, které diagnostiku zkvalitňují a zrychlují. V mé práci se však zabývám pouze metodami, které se používají rutinně v klinických mikrobiologických laboratořích. Mezi tyto metody patří kultivační průkaz mikrobů, biochemické dourčování, provádění testů citlivosti. Standardním postupem je kultivační průkaz. Biochemické testy se používají k identifikaci mikrobů. Antigenní analýza slouží k bližšímu dourčení bakterií. Nedílnou součástí je stanovení citlivosti na antibiotika, které jsou důležité pro správnou léčbu. V praktické části popisuji laboratorní diagnostiku bakteriálních střevních patogenů z výtěru stolice, kterou používají v akreditované Soukromé mikrobiologické laboratoři RNDr. Aleny Veselské v Ústí nad Labem, a kterou jsem sama prováděla během své praxe na pracovišti. Ve výsledcích pak shrnuji výsledky z laboratoře za období říjen 2012 až březen 2013. Pozitivní výsledky porovnávám s daty získané z Epidatu ze Státního zdravotního ústavu v Praze uvedené ve zprávě Centra epidemiologie a mikrobiologie. Dále jsem zpracovala nálezy střevních patogenů za období roku 2003 do roku 2012 jak byly zveřejněny ve zprávách CEM SZÚ v Praze. Z výsledků vyplívá, že nejčastějším hlášeným bakteriálním střevním patogenem od roku 2003 až 2006 v České republice byla Salmonella. Následuje mikrob rodu Campylobacter. Situace se změnila v roce 2007, kdy rod Campylobacter se v počtu záchytů v České republice dostal na první místo. Oproti dvoum jmenovaným bakteriím se nálezy shigel objevují poměrně sporadicky.

Abstract:

My bachelor thesis focuses on the most frequent bacterial causes of intestinal diseases in adults in the Czech Republic. I deal with bacterial intestinal pathogens of Salmonella, Shigella, Yersinia, Campylobacter genus. The theoretical part characterises the selected intestinal bacterial pathogens and their microbial diagnostics. In the present time of progress various new and modern methods and instruments keep appearing to accelerate and improve diagnostics. But I focus exclusively on methods used as a routine in clinical microbiological laboratories. These methods include cultivation of microbes, biochemical specification and sensitivity tests. The proof by cultivation is a standard procedure. Biochemical tests are used for microbe identification. Antigen analysis is used for further specification of bacteria. Specification of sensitivity to antibiotics for correct therapy is an integral part of this method. The practical part describes laboratory diagnostics of bacterial intestinal pathogens from stool swab used by the accredited microbial laboratory of RNDr. Alena Veselská in Ústí nad Labem, which I performed in practice while on scholarship there. The results summarise laboratory results from the period October 2012 to March 2013. positive results are compared to the data obtained from Epidate of the National Healthcare Institute in Prague included in the report of the Epidemiology and Microbiology Centre. I have further processed finds of intestinal pathogens in the period 2003 to 2012 published in CEM reports. The results show that the most frequently reported bacterial intestinal pathogen in the Czech Republic in the period 2003 to 2006 was Salmonella, followed by Campylobacter. Situation changed in 2007, when diagnosed Campylobacter moved to the top rank in the Czech Republic. In contrast to the two abovementioned bacteria finds of Shigella are relatively scarce.

Keywords

střevní mikroby, rod Salmonella, rod Shigella, rod Yersinia, rod Campylobacter, mikrobiologická diagnostika

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 3. 5. 2013

Accessible from:: 3. 5. 2013

Thesis defence

• Supervisor: RNDr. Alena Veselská

UNIVERSITY OF SOUTH BOHEMIA IN ČESKÉ BUDĚJOVICE

Faculty of Health and Social Studies

Bachelor programme / field:
Specialization in Health Service / Zdravotní laborant