Kvantitativní zastoupení bakterií rodu Lactobacillus v lidském zažívacím traktu v závislosti na změně stravovacích návyků

Bc. Kateřina Kolísková

Master's thesis

Quantitative representation of Lactobacillus bacterial family in the human digestive tract depending on changes in eating habits

Abstract:

Diplomová práce se zabývá problematikou kvantitativního zastoupení bakteriálních rodů v lidském zažívacím traktu v závislosti na změně stravovacích zvyklostí. Začátek literárního přehledu se věnuje obecné charakteristice střevního mikrobiomu a jejímu bakteriálnímu zastoupení. Nejobsáhlejší část patří jednotlivým faktorům, které ovlivňují celkový počet bakteriálních druhů osídlujících střevní mikrobiom. Poslední kapitoly teoretické části jsou věnovány kultivačním a molekulárně biologickým metodám, které jsou využívány pro vyšetření lidského zažívacího traktu. Experimentální část se zaměřuje na rozdíly počtu jednotlivých bakterií ve vzorcích lidské stolice, jejichž přítomnost byla stanovena prostřednictvím kultivačních metod. U rodu Lactobacillus byla provedena izolace bakteriálního DNA, která byla následně potvrzena polymerázovou řetězovou reakcí. U výsledných hodnot byly pozorovány nepatrné změny, přičemž na konci druhého období došlo k nárůstu počtu bakterií druhu L. acidophilus a L. rhamnosus (p < 0,05). S výjimkou rodu Bacteroides měly ostatní bakteriální rody tendenci klesat (p > 0,05). Na základě získaných dat ze záznamů stravy byly pozorovány změny v konzumaci základních makroživin (bílkoviny, tuky, sacharidy) a vlákniny. Pouze u sacharidů a jednoduchých cukrů byl zaznamenán statisticky průkazný rozdíl (p > 0,05). Konečná analýza potvrdila, že změna stravovacích návyků neměla vliv na celkový počet bakteriálních druhů osídlujících střevní mikrobiom.

Abstract:

This diploma thesis deals with the issue of quantitative representation of the bacterial family in the human digestion system depending on changes in eating habits. The start of literary digest addresses general characteristics of digestion microbiome and its bacterial represen-tation. The most comprehensive part belongs to individual factors, who influenced overall number of bacterial species inhabiting the digestion microbiome. The last chapters of the theoretical part belong to cultivative and molecular biological methods, which are used in examination of the human digestion tract. Experimental part focuses on differences in the number of individual bacteria in the samples of human excrements, whose presence was determined by cultivative methods. Isolation of bacterial DNA was performed, which was subsequently confirmed by polymerase chain reaction. In resulting values, we observed small changes (p < 0,05) in bacterial species L. acidophilus a L. rhamnosus at the end of the second period. All bacterial families, except Bacteroides, had downward tendency (p > 0,05). Based on acquired data from food records, we observed changes in consumption of basic macronutrients (protein, fat, carbohydrates) and fiber. Only in carbohydrates and sim-ple sugars, we observed statistically provable differences (p > 0,05). Final analysis proved that changes in eating habits did not influence the total number of bacterial species inhabiting digestion microbiome.

Keywords

střevní mikrobiom, obezita, molekulárně biologické metody, kultivační metody, mikrobiální metabolismus, stravovací návyky, makroživiny, mikrobiální rozmanitost, výživa

Keywords

microbial metabolism, obesity, macronutriens, gut microbiome, cultivation methods, molecular biological methods, microbial diversity, nutrition, dietary patterns

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 20. 4. 2023

Thesis defence

• Date of defence: 29. 5. 2023
• Supervisor: Ing. Gabriela Franke, Ph.D.
• Reader: Hana Přikrylová, externi

Mendel University in Brno

Faculty of AgriSciences

Master programme / specializace:
Food and Beverage Human Nutrition / Human Nutrition