Mgr. Petr Beneš, Ph.D.

Advanced ('rigorózní') thesis

Computation and analysis of tunnels in protein molecules based on Computational geometry

Computation and analysis of tunnels in protein molecules based on Computational geometry
Abstract:
Výpočet tunelů v molekulách proteinů hraje důležitou roli v oblasti analýzy proteinů a při hledání nových léků. Je důležité zabývat se celkovou analýzou tunelů spojujících konkrétní dutinu uvnitř molekuly proteinu s povrchem molekuly. Pro analýzu statických molekul proteinů existují různé techniky pro výpočet tunelů, některé jsou založeny na základních strukturách výpočetní geometrie -- Voroného diagramu …more
Abstract:
Computation of tunnels in protein molecules is an important area in protein analysis. It is crucial to perform complex analysis of tunnels connecting the specified cavity inside the protein molecule with the surface of the molecule. Various techniques, mainly based on the Voronoi diagram and Delaunay triangulation, have been proposed to analyze tunnels in static molecules. However, protein molecules …more
 
 
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 16. 6. 2008

Thesis defence

  • Date of defence: 23. 6. 2008

Citation record

Full text of thesis

Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:
  • světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Fakulta informatiky