Paralelizace analýzy molekulárně dynamických simulací – Bc. Jakub Štěpán, Ph.D.
Bc. Jakub Štěpán, Ph.D.
Bachelor's thesis
Paralelizace analýzy molekulárně dynamických simulací
Parallelization of analysis of molecular dynamics simulation
Anotácia:
Molekulární dynamika je široce používaná metoda výpočetní chemie. S rostoucí velikostí simulovaných systémů a délkou simulací se stává analýza výsledných trajektorií časově náročná. Proto je snaha tyto analýzy urychlit. V této práci jsem se zaměřil na návrh, implementaci a otestování možností paralelního zpracování trajektorií. Moje implementace byla vytvořena pro výpočet volné vazebné energie z trajektorií …viacAbstract:
Molecular dynamics is a widely used method of computational chemistry. With growing size of simulated systems and length of simulations, analysis of resulting trajectories becomes time demanding. Thus there is need for tools that speed this analysis up. In this work I designed, implemented and tested one solution of this problem and I implemented tools that analyse trajectory in parallel. My implementation …viac
Jazyk práce: English
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 7. 1. 2008
Identifikátor:
https://is.muni.cz/th/ywdo0/
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 6. 2. 2008
- Vedúci: doc. RNDr. Radka Svobodová Vařeková, Ph.D.
- Oponent: Mgr. Jan Kmuníček, Ph.D.
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasaryk University
Faculty of InformaticsBachelor programme / odbor:
Informatics / Informatics