Bc. Jakub Štěpán, Ph.D.

Bakalářská práce

Paralelizace analýzy molekulárně dynamických simulací

Parallelization of analysis of molecular dynamics simulation
Anotace:
Molekulární dynamika je široce používaná metoda výpočetní chemie. S rostoucí velikostí simulovaných systémů a délkou simulací se stává analýza výsledných trajektorií časově náročná. Proto je snaha tyto analýzy urychlit. V této práci jsem se zaměřil na návrh, implementaci a otestování možností paralelního zpracování trajektorií. Moje implementace byla vytvořena pro výpočet volné vazebné energie z trajektorií …více
Abstract:
Molecular dynamics is a widely used method of computational chemistry. With growing size of simulated systems and length of simulations, analysis of resulting trajectories becomes time demanding. Thus there is need for tools that speed this analysis up. In this work I designed, implemented and tested one solution of this problem and I implemented tools that analyse trajectory in parallel. My implementation …více
 
 
Jazyk práce: angličtina
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 7. 1. 2008

Obhajoba závěrečné práce

  • Obhajoba proběhla 6. 2. 2008
  • Vedoucí: doc. RNDr. Radka Svobodová Vařeková, Ph.D.
  • Oponent: Mgr. Jan Kmuníček, Ph.D.

Citační záznam

Plný text práce

Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:
  • světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Fakulta informatiky

Masarykova univerzita

Fakulta informatiky

Bakalářský studijní program / obor:
Informatika / Informatika

Práce na příbuzné téma