Hostitelský okruh viru kroužkovitosti jeřábu ptačího

Bc. Tereza Baťová

Diplomová práce

Host range of Europen mountain ash ringspot-associated virus

Anotace:

Diplomová práce se zabývá biologickou charakterizací jeřábu ptačího, viru kroužkovitosti jeřábu ptačího (European mountain ash ringspot-associated virus, EMARaV) a přenosem patogena pomocí oček a šťávy z infikovaných rostlin. V roce 2016 probíhal v prostorách skleníků katedry ochrany rostlin České zemědělské univerzity v Praze experimentální přenos viru kroužkovitosti jeřábu ptačího na bylinné hostitele z rodu Nicotiana. V rámci studie byl sledován vliv několika důležitých aspektů na úspěšnost přenosu patogena, jmenovitě zdroj inokula, doba přenosu a hostitelský okruh. Od jara téhož roku probíhala současně také studie hostitelského okruhu EMARaV v rámci dřevinných druhů z čeledi Rosaceae a podčeledi Maloideae, které byly experimentálně naočkovány v roce 2015. Bylo použito celkem 24 rostlinných druhů a odrůd. Patogen byl opět v rostlinném pletivu detekován pomocí RT-PCR. Dále byla sledována a fotodokumentována symptomatologie viru na dřevinách. Patogen byl v rostlinném pletivu detekován s využitím modifikované izolace celkové RNA silika metodou dle Rott a Jelkmann (2001) s použitím 2% metabisulfátu sodného a pomocí molekulární metody RT-PCR. Vizualizace PCR amplikonů probíhala na agarózové elektroforéze pomocí separace nukleových kyselin. Na základě získaných výsledků byla přítomnost EMARaV potvrzena na čtyřech inokulovaných druzích a odrůdách tabáku (N. benthamiana, N. occidentalis, N. occidentalis subsp. obliqua a N. tabacum ´White Burley´) z celkových jedenácti testovaných druhů a odrůd. Žádné symptomy infekce EMARaV nebyly na infekčních tabácích pozorovány. Přenos EMARaV pomocí infikovaných oček byl potvrzen a známý hostitelský okruh patogena byl rozšířen o pět kultivarů S. aucuparia: ´Dezertnaja´, ´Kubovaja´, ´Likernaja´, ´Titan´, ´Businka´ a Chaenomeles ´Grimson/Gold´. Symptomy spojované s přítomností EMARaV se projevovaly na listech v podobě nažloutlých šedozelených lézí, chlorotických kruhových skvrn nebo chlorotického mramorování. Lze provést diagnostiku na základě symptomů, které jsou velmi dobře rozpoznatelné. V rámci této diplomové práce nebyla pozorována žádná latentní infekce.

Abstract:

The thesis deals with biological characterization of the European mountain ash and also its ring virus (European mountain ash ringspot-associated virus, EMARaV) and pathogen transmission by loops and juices from infected plants. In 2016 the experimental transmission of the EMARaV on herbal hosts from the genus Nicotiana took place in areas of greenhouses of plant protection department of the Czech University of Life Sciences Prague. Within study it was examined the effect of several important aspects of the success of pathogen transmission, namely a source of inoculum, time of transmission and host range. Since the spring of that year had been going a study of host range EMARaV within woody species from family Rosacaae and subfamily Maloideae that were experimentally inoculated in 2015. It was used totally 24 plant species and cultivars. Patogen was again detected in a plant tissue by RT-PCR. It had also been monitored and documented symptomatology virus on woods. The pathogen was detected in plant tissue with using of modified isolation of total RNA silica method by Rott Jelkmann (2001) with using 2% sodium metabisulfate and molecular methods RT-PCR. Visualization of PCR amplicons was carrying out on agarose electrophoresis by separation of nucleic acids. Based on obtained results was confirmed the presence EMARaV on four inoculated species and cultivars of tobacco (N. benthamiana, N. occidentalis, N. occidentalis subsp. obliqua and N. tabacum 'White Burley') out of a total of eleven test species and cultivars. No symptoms of infection EMARaV were observed on infectious tobaccos. EMARaV transmission through infected loops was confirmed and a known host range pathogen was extended by five cultivars S. aucuparia: ´Dezertnaja´, ´Kubovaja´, ´Likernaja´,´Titan´, ´Businka´ and Chaenomeles ´Grimson/Gold´. Symptoms associated with the presence EMARaV were manifested on leaves in the form as yellowish gray-green lesions, chlorotic ring spots or chlorotic marbling. It is posible to make the diagnosis based on the symptoms that are very recognizable. In the context of this thesis was no significant latent infection.

Klíčová slova

EMARaV, jeřáb ptačí, přenos viru, hostitelský okruh

Keywords

European mountain ash, EMARaV, virus transmission, host range

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 13. 4. 2017

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Ing. Lenka Grimová, Ph.D.
• Oponent: Jaroslav Salava, externi

Česká zemědělská univerzita v Praze

Fakulta agrobiologie, potravinových a přírodních zdrojů

Magisterský studijní program / obor:
Zahradnictví / Produkční zahradnictví