Arabinosa a její využití při studiu vlastností lektinů

Bc. Jakub Bůbela

Bachelor's thesis

Arabonose and its utilization in characterization of lectin properties

Anotácia:

Tato práce je zaměřena na sacharid arabinosu a možnosti jejího využití při studiu vlastností lektinů, především lektinu RSL z bakterie Ralstonia solanacearum. Cílem práce bylo objasnění interakcí mezi arabinosou a lektinem a purifikace lektinu na koloně s imobilizovanou arabinosou. Lektin RSL byl připraven kultivací bakteriálních buněk a následnou purifikací s využitím afinitní chromatografie. Vazebné interakce mezi RSL a arabinosou byly studovány pomocí izotermální titrační kalorimetrie a termoforézy. Byla provedena krystalizace RSL s D-arabinosou. RSL byl úspěšně purifikován afinitní chromatografií na koloně D-arabinosa-sepharosa.

Abstract:

This thesis focuses on carbohydrate arabinose and its possible use when studying properties of lectins, primarily the properties of lectin RSL from bacteria Ralstonia solanacearum. The goal of this work was clarification of interactions between arabinose and the lectin and purification of the lectin on arabinose column. Lectin RSL was prepared by cultivation of bacteria cells followed by affinity chromatography. Binding interactions between RSL and arabinose were studied by isothermal titration calorimetry and microscale thermophoresis. A crystallization of RSL with D-arabinose was carried out. RSL was successfully purified by affinity chromatography on D-arabinose-sepharose column.

Kľúčové slová

arabinosa, lektiny, RSL, specifita, vazba, arabinose, lectins, specificity, binding

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 19. 5. 2022

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 20. 6. 2022
• Vedúci: prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.
• Oponent: Mgr. Filip Melicher

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Biochemistry / Applied biochemistry