Ověření souvislosti genů \kur{enol-1} a \kur{astacinu} s evoluční adaptací na parazitismus u druhu \kur{Heterorhabditis bacteriophora}

Bc. Jan HARTMANN

Diplomová práce

Anotace:

Zaměřením této práce byla možná spojitost dvou kandidátních genů, enol-1 a astacinové metalopeptidázy, s adaptacemi na parazitický způsob života u hlístice Heterorhabditis bacteriophora.Ačkoliv experimentální umlčování genů nepodporuje spojitost (zejména kvůli neuspěšné provedené metodě "soaking")biostatistická analýza ortologů z 25 druhů vybraných napříč klady III, IV a V nalezla známky episodické selekce. Bohužel nebyla zjištěna vazba na parazitické druhy, jelikož převažujícím typem selekce byla selekce purifikační. S větší pravděpodobností jsou kandidátní geny konzervované, než spojeny s adaptačním tlakem spojeným s parazitismem.

Abstract:

This thesis was focused on the verification wheter the two candidate genes, enol-1 and astacin metalloprotease, are linked to the parasitic adaptation of Heterorhabditis bacteriophora. While the expression analysis and knock-down of those genes by RNAi did not corroborate thwe hypothesis, biostatistical evolutionary analysis of orthologs from 25 nematode species across clades III, IV and V found several footprints of episodic diversifying selection. However, none of this was strictly linked to the parasitic species. Since the prevailing detected selection was purifying, both candidate genes are more likely conserved and not directly shaped by adaptation to parasitism.

Klíčová slova

Evoluce parazitismu, vliv selekce, Entomopatogenní hlístovka

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 22. 2. 2020

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: PaedDr. Martina Žurovcová, Ph.D.

JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biologie / Experimentální biologie - specializace Molekulární a buněčná biologie a genetika