Variabilita mikrosatelitů kleštíka včelího (Varroa destructor)

Tereza ŠINKMAJEROVÁ

Bachelor's thesis

Microsatellite variability in mite Varroa destructor

Abstract:

Tato bakalářská práce se zabývá optimalizací PCR amplifikace známých mikrosatelitových lokusů kleštíka včelího (Varroa destructor) s cílem zjištění jejich variability v rámci České republiky.Teoretická část pojednává o biologické charakteristice kleštíka včelího včetně jeho zařazení do systému, historii rozšíření, morfologii a životním cyklu. Dále se věnuje patologickému působení tohoto parazita ve vztahu ke včele medonosné (Apis mellifera), jeho monitoringu, metodám léčby a genetické charakteristice s důrazem na studium genetické variability pomocí mikrosatelitových markerů.Experimentální část je zaměřena na optimalizaci PCR amplifikace provedenou se 33 páry primerů pro polymorfní mikrosatelitové lokusy kleštíka včelího a hledaní lokusů, které vykazují polymorfismus v rámci České republiky. Lokus vj296 neposkytl žádný produkt, zbylých 32 lokusů poskytujících produkt bylo na základě testů rozděleno do tří skupin. První skupina zahrnuje 25 monomorfních lokusů, druhá obsahuje lokus vj275, jehož produkt byl polymorfní ale naprosto nehodnotitelný a zbylých 6 lokusů bylo polymorfních hodnotitelných se 2-3 alelami. Polymorfní a hodnotitelné mikrosatelity byly analyzovány populačně genetickými programy.

Abstract:

This bachelor thesis focuses on the optimization of PCR amplification of known microsatellite loci of the mite Varroa destructor in order to determine their variability in populations of these mites in the Czech Republic.The theoretical part deals with the biological characteristics of Varroa destructor, including its system classification, history of distribution, morphology and life cycle. It also discusses the pathological effects of this parasite in relation to the honey bee (Apis mellifera), its monitoring, treatment methods and genetic characterisation with emphasis on the study of genetic variability using microsatellite markers.The experimental part is focused on the optimization of PCR amplification performed with 33 primer pairs for polymorphic microsatellite loci of Varroa destructor and searching for loci that show polymorphism within the Czech Republic. The locus vj296 did not amplify any product. Based on the tests the remaining 32 product-amplifying loci were divided into three groups. The first group includes 25 monomorphic loci, the second group contains locus vj275 whose product was polymorphic but not evaluable and the remaining 6 loci were polymorphic and evaluable with 2-3 alleles. Polymorphic and evaluable microsatellites were analyzed by population genetic softwares.

Keywords

Kleštík včelí, Varroa destructor, mikrosatelity, genetická variabilita

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 3. 5. 2024

Thesis defence

• Supervisor: RNDr. Petr Nádvorník, Ph.D.

Palacký University Olomouc

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Biology / Molecular and Cell Biology