Stanovení citlivosti populací houby Venturia inaequalis (Cke.) Wint. z vybraných produkčních výsadeb ke strobilurinovým fungicidům

Pavlína Jaklová

Master's thesis

Determination of sensivity to strobilurin fungicides in populations of Venturia inaequalis (Cke.) Wint. of selected production orchard

Abstract:

Houba Venturia inaequalis (Cke.) Wint. je závažným patogenem jabloní způsobující hospodářsky nejvýznamnější chorobu - strupovitost. Ošetření fungicidy je primárním nástrojem regulace tohoto patogena. Toto intenzivní používání fungicidů má za následek více či méně rychlý rozvoj rezistence a tím i pokles citlivosti patogena k několika používaným skupinám fungicidů. Cílem této práce bylo stanovení citlivost populací patogena V. inaequalis z vytipovaných lokalit k vybrané fungicidní látce kresoxim-methyl ze skupiny QoI inhibitorů Citlivost byla hodnocena v in vitro (testy klíčivosti spor, růst mycelia na agaru) a in vivo (skleníkové testy na jabloňových semenáčcích) podmínkách a pomocí molekulárních metod detekovat gen rezistence u vybraných izolátů patogena. Bylo získáno celkem 20 vzorků populace V. inaequalis z odebraných infikovaných listů jabloně z vytipovaných lokalit. Výsledky testů prokázaly u čtyř vzorků populace V. inaequalis vznik rezistence. U osmi vzorků se projevila značně snížená citlivost populací V. inaequalis. Zbývající počet vzorků (6) lze označit jako populace houby se sníženou citlivostí k fungicidu Discus. Nejvyšší účinnost přípravku Discus a nejvyšší citlivost k účinné látce kresoxim-methyl se projevila u vzorku tzv. "divoké" populace V6, která byla odebírána z nešetřovaného stromu. Pro potvrzení vzniku rezistence na základě jednobodové mutace v cytochromu b byly tři monosporické izoláty V. inaequalis ze vzorků populace V1, V2 a V4 testovány molekulární metodou přímé sekvenace mitochondriálního genomu. U všech tří monosporických izolátů V. inaequalis byla nalezena jednobodová mutace, při které dochází ke změně z glycinu na alanin v pozici 143 (G143A) a způsobuje tak rezistenci ke strobilurinovým fungicidům.

Abstract:

The fungus Venturia inaequalis (Cke.) Wint. is an important pathogen of apple trees causing the most economically important disease -- apple scab. Fungicide treatment is the primary tool to control this pathogen. The intensive uses of fungicides have consequence a more or less rapid development of resistance and thus decrease the sensitivity of the pathogen to several of groups used fungicides. The aim of this study was to determine the sensitivity of pathogen populations of V. inaequalis from selected localities for fungicidal substance kresoxim-methyl from group QoI inhibitors. Sensitivity was evaluated in in vitro (germination spores assays, mycelium growth on agar assays) and in vivo (greenhouse assays on apple seedlings) conditions and using molecular methods to detect resistance gene of selected isolates of the pathogen. A total number of 20 samples of the population V. inaequalis from infected leaves of apple collected from the selected locations. Assays results showed in the four samples of population V. inaequalis development of resistance. Eight samples of populations V. inaequalis demonstrated significant decrease of sensitivity. The remaining number of samples (6) can be described as the population of fungus with decrease of sensitivity to the fungicide Discus. Discus highest efficacy and the highest sensitivity to the kresoxim-methyl was demonstrated on the sample "wild" population V6, which was collected from non treatment tree. To confirm the development of resistance on the basis of a single point mutation in the cytochrome b, three monosporic isolates of V. inaequalis populations from samples V1, V2 and V4 were tested by direct sequencing the mitochondrial genome. In all three monosporic isolates of V. inaequalis was found single point mutation, involving a change from glycine to alanine at position 143 (G143A), causing the resistance to strobilurine fungicides.

Keywords

Venturia inaequalis, Malus domestica, strobilurin, Strupovitost jabloně, testování citlivosti, kresoxim-methyl, rezistence

Keywords

apple scab, Venturia inaequalis, Malus domestica, strobilurine, kresoxim-methyl, resistance, testing of sensitivity

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 10. 4. 2015

Thesis defence

• Supervisor: Ing. Jana Mazáková, Ph.D.

Czech University of Life Sciences Prague

Faculty of Agrobiology, Food and Natural Resources

Master programme / field:
Plant Protection / Plant Protection