Studium interakce alkaloidů stylopinu, koptisinu a korysaminu s DNA

Bc. Andrea Slaninková

Master's thesis

Study on interaction of alkaloids stylopine, coptisine and corysamine to DNA

Abstract:

This diploma thesis deals with the study of interaction of selected quaternary protoberberine and tetrahydroprotoberberine alkaloids with double-stranded DNA and noncanonical form of DNA (G-quadruplex). Influence of selected alkaloids on stability of double-stranded DNA and noncanonical form of DNA by determing of association constants of alkaloid-DNA complexes was observed using two spectroscopic methods − molecular absorption spectrometry and fluorescence spectrometry. Influence of selected alkaloids on stability of non-canonical form of DNA by determing of melting point of oligonucleotides forming G-quadruplex DNA was studied, melting point values were determined using molecular absorption spectrometry and CD spectrometry.

Abstract:

Diplomová práce se zabývá studiem interakce vybraných kvartérních protoberberínových a tetra-hydroprotoberberínových alkaloidů s dvouvláknovou DNA a nekanonickou formou DNA (G- -kvadruplexem). Pozornost byla věnována vlivu vybraných alkaloidů na stabilitu dvouvláknové DNA a nekanonické struktury DNA určením asociačních konstant komplexů alkaloid-DNA po-mocí dvou spektroskopických metod – molekulové absorpční spektrometrie a fluorescenční spek-trometrie. Dále byl studován vliv vybraných alkaloidů na stabilitu nekanonické struktury DNA určením změny teploty tání oligonukleotidů formujících G-kvadruplex DNA, přičemž byly teploty tání určeny pomocí molekulové absorpční spektrometrie a CD spektrometrie.

Keywords

alkaloidy, KPA, THPBA, cirkulárny dichroizmus, molekulová absorpčná spektrometria, fluorescenčná spektrometria, G4 DNA, dsDNA, stylopín, koptyzín, koryzamín, teplota topenia, asociačná konštanta, TDS, komplex, oligonukleotid, TEL22, DL_40, chair_1, alkaloids, QPA, circular dichroism, molecular absorption spectrometry, fluorescence spectrometry, stylopine, coptisine, corysamine, melting point, association constant, complex, oligonucleotide

Language used: Slovak

Date on which the thesis was submitted / produced: 10. 5. 2016

Thesis defence

• Date of defence: 1. 6. 2016
• Supervisor: doc. Mgr. Petr Táborský, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / field:
Chemistry / Analytical Chemistry