Refaktorizace kódu a implementace urychlujících algoritmů do programu AutoGrid – Bc. Marek Olšák
Bc. Marek Olšák
Bachelor's thesis
Refaktorizace kódu a implementace urychlujících algoritmů do programu AutoGrid
Code Refactorization and Implementation of Algorithms Speeding-up AutoGrid
Abstract:
Obsahem této práce je nalezení, implementace a popis urychlujících metod do programu AutoGrid, který počítá prostorovou mřížku potenciálních energií okolo molekuly. Podrobně popisujeme použité datové struktury a algoritmy, stejně jako jejich paralelizaci na více procesorových jader. Zabýváme se také efektivní implementací výpočtu elektrostatických energií, které AutoGrid počítá, na grafických procesorech …moreAbstract:
The content of this thesis is finding, implementing and describing acceleration methods in the program AutoGrid, which computes a spatial grid of potential energies around a molecule. We describe used data structures and algorithms in detail, as well as their parallelization on multi-core processors. We also deal with an efficient implementation of an electrostatic energy calculation, which AutoGrid …more
Language used: Czech
Date on which the thesis was submitted / produced: 25. 5. 2009
Identifier:
https://is.muni.cz/th/v5mp1/
Thesis defence
- Date of defence: 4. 2. 2010
- Supervisor: RNDr. Jiří Filipovič, Ph.D.
- Reader: doc. RNDr. Petr Holub, Ph.D.
Citation record
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasaryk University
Faculty of InformaticsBachelor programme / field:
Applied Informatics / Applied Informatics
Theses on a related topic
-
Akcelerace kódu Autodock Vina na Xeon Phi
Tomáš Ritter