Refaktorizace kódu a implementace urychlujících algoritmů do programu AutoGrid – Bc. Marek Olšák
Bc. Marek Olšák
Bachelor's thesis
Refaktorizace kódu a implementace urychlujících algoritmů do programu AutoGrid
Code Refactorization and Implementation of Algorithms Speeding-up AutoGrid
Anotácia:
Obsahem této práce je nalezení, implementace a popis urychlujících metod do programu AutoGrid, který počítá prostorovou mřížku potenciálních energií okolo molekuly. Podrobně popisujeme použité datové struktury a algoritmy, stejně jako jejich paralelizaci na více procesorových jader. Zabýváme se také efektivní implementací výpočtu elektrostatických energií, které AutoGrid počítá, na grafických procesorech …viacAbstract:
The content of this thesis is finding, implementing and describing acceleration methods in the program AutoGrid, which computes a spatial grid of potential energies around a molecule. We describe used data structures and algorithms in detail, as well as their parallelization on multi-core processors. We also deal with an efficient implementation of an electrostatic energy calculation, which AutoGrid …viac
Jazyk práce: Czech
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 25. 5. 2009
Identifikátor:
https://is.muni.cz/th/v5mp1/
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 4. 2. 2010
- Vedúci: RNDr. Jiří Filipovič, Ph.D.
- Oponent: doc. RNDr. Petr Holub, Ph.D.
Citační záznam
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasaryk University
Faculty of InformaticsBachelor programme / odbor:
Applied Informatics / Applied Informatics
Práce na příbuzné téma
-
Akcelerace kódu Autodock Vina na Xeon Phi
Tomáš Ritter