Analýza genomu a charakteristika ETA bakteriofágů u toxinogenních kmenů Staphylococcus aureus

Bc. Pavel Mikel, Ph.D.

Master's thesis

Genomic analysis and characteristics of the ETA bacteriophages in toxigenic strains of Staphylococcus aureus

Anotácia:

V této diplomové práci se zabývám analýzou a charakteristikou genomu tří dosud nepopsaných stafylokokových eta-pozitivních bakteriofágů čeledi Siphoviridae. Gen eta obsažený v genomu těchto bakteriofágů kóduje exfoliativní toxin A, který je u lidí příčinou epidermolýz. Příznaky onemocnění vyvolaného působením exfoliativních toxinů se liší od mírných lokalizovaných kožních lézí (bulózní impetigo) po život ohrožující stavy, projevující se narušením rozsáhlých ploch epidermis (stafylokokový syndrom opařené kůže). V populacích bakteriálního druhu Staphylococcus aureus se gen eta šíří prostřednictvím vertikálního a horizontálního přenosu genů. Studované eta-pozitivní bakteriofágy byly indukovány z klinických kmenů Staphylococcus aureus izolovaných v českých nemocnicích v letech 2009 a 2010.

Abstract:

In this thesis I deal with the analysis and genome characterization of three previously undescribed staphylococcal eta-positive bacteriophages of the family Siphoviridae. Eta gene contained in the genome of this bacteriophages encoding exfoliative toxin A, which is the major cause of human epidermolysis. Skin disorders caused by the action of exfoliative toxins vary from mild localized blisters and/or lesions (bullous impetigo) to life-threatening conditions, manifested by disruption of the large areas of the epidermis (staphylococcal scalded skin syndrome). In populations of Staphylococcus aureus is the eta gene spread through vertical and horizontal gene transfer. The eta-positive bacteriophages studied in this diploma thesis were induced from clinical strains of Staphylococcus aureus isolated in Czech maternity hospitals between 2009 and 2010.

Kľúčové slová

Bakteriofág, genom, analýza DNA, exfoliativní toxiny, Staphylococcus aureus, Bacteriophage, genome, DNA analysis, exfoliative toxins

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 14. 5. 2012

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 14. 6. 2012
• Vedúci: doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Biology / Molecular Biology and Genetics